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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 16srDNA
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xxls1990

铁虫 (初入文坛)

[求助] 16srDNA 已有1人参与

不好意思啊，我是个新手，很多问题都不懂，最近做的课题碰到这样一个难题，就是提取到DNA时需要PCR，但在引物设计这一块，老师给的意见就是16sRDNA功能性基因片段扩增、 一直没能理解是个什么意思，这个16srDNA是不是就是一个保守型序列呢？我做的是金黄色葡萄球菌，沙门氏菌，志贺氏菌这几种菌，其实之前自己用引物设计软件设计过，但老师觉得应该去找特异性比较好的，我就费解了，真心不懂事几个意思？求帮忙
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力求最好
1楼 2013-10-09 19:33:46
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liuweipeng

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by liuweipeng at 2013-12-16 22:17:25
最近我正好看到一个文献，你可以参考A magneto-DNA nanoparticle system for rapid detection and phenotyping of bacteria

你直接照抄里面引物就行，都是设计好了的。
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6楼2013-12-16 22:18:20
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-12-17 09:59:39
找特异性比较好的可以不用自己设计，查文献就好，中文查不到的话查英文。
16srDNA是怎么回事，你还是自己好好查一查吧，坦白讲，这个问题很简单啊！
告诉你的话很容易，可是还是希望你自己锻炼一下！祝您好运！
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2楼2013-10-10 15:03:56
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xxls1990

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lvshilu at 2013-10-10 15:03:56
找特异性比较好的可以不用自己设计，查文献就好，中文查不到的话查英文。
16srDNA是怎么回事，你还是自己好好查一查吧，坦白讲，这个问题很简单啊！
告诉你的话很容易，可是还是希望你自己锻炼一下！祝您好运！

非常感谢，但我脑子还是有点转不过来！我查的资料显示，16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因，在细菌的16SrDNA中有多个区段保守性，根据这些保守区可以设计出细菌通用物，可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段，并且这些引物仅对细菌是特异性的，但还是不是很明白，比如说我做的的是副溶血性弧菌，那这种菌的16srDNA是什么呢？要去NCBI找吗？？
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力求最好
3楼2013-10-10 15:53:11
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

Vibrio parahaemolyticus partial 16S rRNA gene, culture collection CECT 611
GenBank: FM204867.1
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4楼2013-10-11 09:46:57
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