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xxls1990

铁虫 (初入文坛)

[求助] 16srDNA 已有1人参与

不好意思啊,我是个新手,很多问题都不懂,最近做的课题碰到这样一个难题,就是提取到DNA时需要PCR,但在引物设计这一块,老师给的意见就是16sRDNA功能性基因片段扩增、 一直没能理解是个什么意思,这个16srDNA是不是就是一个保守型序列呢?我做的是金黄色葡萄球菌,沙门氏菌,志贺氏菌这几种菌,其实之前自己用引物设计软件设计过,但老师觉得应该去找特异性比较好的,我就费解了,真心不懂事几个意思?求帮忙
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xxls1990

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvshilu at 2013-10-10 15:03:56
找特异性比较好的可以不用自己设计,查文献就好,中文查不到的话查英文。
16srDNA是怎么回事,你还是自己好好查一查吧,坦白讲,这个问题很简单啊!
告诉你的话很容易,可是还是希望你自己锻炼一下!祝您好运!

非常感谢,但我脑子还是有点转不过来!我查的资料显示,16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基,16SrDNA就是编码该亚基的基因,在细菌的16SrDNA中有多个区段保守性,根据这些保守区可以设计出细菌通用物,可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段,并且这些引物仅对细菌是特异性的,但还是不是很明白,比如说我做的的是副溶血性弧菌,那这种菌的16srDNA是什么呢?要去NCBI找吗??
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3楼2013-10-10 15:53:11
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-12-17 09:59:39
找特异性比较好的可以不用自己设计,查文献就好,中文查不到的话查英文。
16srDNA是怎么回事,你还是自己好好查一查吧,坦白讲,这个问题很简单啊!
告诉你的话很容易,可是还是希望你自己锻炼一下!祝您好运!
需要金币
2楼2013-10-10 15:03:56
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

Vibrio parahaemolyticus partial 16S rRNA gene, culture collection CECT 611
GenBank: FM204867.1
需要金币
4楼2013-10-11 09:46:57
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liuweipeng

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-17 09:59:46
最近我正好看到一个文献,你可以参考A magneto-DNA nanoparticle system for rapid detection and phenotyping of bacteria
5楼2013-12-16 22:17:25
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