| 查看: 831 | 回复: 1 | |||
lsxx金虫 (小有名气)
|
[求助]
基因上游序列结构分析 已有1人参与
|
| 最近老师让分析目的基因的上游序列，主要是启动子什么的，用什么软件啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有247人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 蛋白表达的序列为什么比基因序列短
已经有6人回复
- 基因序列
已经有8人回复
- 如何查找一段基因序列的启动子？
已经有3人回复
- 关于克隆植物基因启动子序列？
已经有4人回复
- 扩增已知序列旁邻的未知DNA序列
已经有10人回复
- 基因序列怎样转成核苷酸序列
已经有7人回复
- 怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽~~
已经有11人回复
- 序列相似度较低，该如何申请获得基因登陆号
已经有4人回复
- 求助小鼠抗体可变区基因序列提交问题
已经有6人回复
- 如何查找基因的序列号？
已经有4人回复
- 【求助/交流】基因序列的分析
已经有5人回复
- 【求助/交流】寻找基因组序列中的单拷贝基因
已经有8人回复
- 【求助/交流】扩增已知基因的上游序列的方法
已经有9人回复
- 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构
已经有12人回复
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已经有18人回复
【答案】应助回帖
| 对于启动子区的查找，转录起始位点上游2-3kb都有可能是启动子区。首先因为启动子序列在在mRNA中不存在，所以要先查找提供基因组序列的数据库，如：UCSC。在UCSC中可以设置上游2000bp,然后设置外显子用大写字母显示，这样很直观的就可以看到第一个启动子以前几kb的序列，然后可以截取上游2000bp以及之后的几百bp用一些启动子分析软件比如promoter 2.0 或者bimas,这些可以给出TSS的位置，综合各软件预测结果自己分析一下。另外转录起始区还有个重要特征就是cpG岛，可以用CpGplot预测CpGisland的位置，再就是根据自己经验找比如TATA box等的位置，也可以进一步确认一下。 |
2楼2014-01-15 11:08:02