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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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冰凝东

金虫 (小有名气)

[求助] 拟南芥突变体纯合子目的基因仍有表达!真心求助! 已有1人参与

购买的拟南芥T-DNA插入突变体(SALK and CS),T-DNA插入在启动子或者内含子区域都有,提取DNA经PCR鉴定出纯合子,但是以纯合子cDNA为模板进行PCR,仍然可以获得目的基因片段(已测序确定),引物是夸内含子区,且RNA做了DNA酶消化!几个突变体都是这样,不知道大家有么有类似经历,都快郁闷死了,老板天天骂,说是我的问题!真心请教高手解决问题……现行谢过……
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冰凝东

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wangpeng227 at 2013-09-27 15:12:37
Chen, M., and Thelen, J.J. (2013). ACYL-LIPID DESATURASE2 is required for chilling and freezing tolerance in Arabidopsis. Plant Cell 25, 1430-1444.

参考这篇paper吧,转录本降低的突变体,如果表型确定 ...

非常感谢……
9楼2013-09-29 14:34:15
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩 2013-09-26 00:06:01
有可能的, 突变体转录时可以顺带把T-DNA也转录出来, 然后T-DNA作为intron 被割掉...
楼主能定到插入在exon的突变体么?
2楼2013-09-25 20:11:43
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冰凝东

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-09-25 20:11:43
有可能的, 突变体转录时可以顺带把T-DNA也转录出来, 然后T-DNA作为intron 被割掉...
楼主能定到插入在exon的突变体么?

谢谢!突变体是我的老板定的,不太清楚是否可以定到EXON的突变体。
我想问一下T-DNA一般多大?还有就是启动子区域插入T-DNA也有目的基因,这是为何?
3楼2013-09-25 21:14:23
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励应助! 2013-09-27 16:14:03
冰凝东: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-29 14:43:27
突变体可以上TAIR查看, 在sequence viewer里面选你要看的基因区域就可以看到突变体的插入位置. 因为SALK/SAIL一直在更新的, 或许现在有在EXON插入的T-DNA.
T-DNA 大小一般10k 左右(把筛选标记的大小也算进去). 所以当T-DNA出现在基因里面时,转录的时候是完全可能把整个T-DNA一起转录出来再接着转录基因剩下的部分的(虽然TDNA里面自带转录终止片段的).
启动子一般认为是在转录起点前面2到3k的范围里面, 但是这只是一个很模糊的定义. 因为负责基因表达的启动子可以出现在基因里面(比如说AGAMOUS, 它的启动子在intron里面), 甚至3'的地方.
4楼2013-09-26 19:11:04
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