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MD进行分子模拟关于计算键角张力的问题 已有1人参与
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| 我打算用分子动力学模拟基于DNA连接的纳米粒子的自组装,但是在构建初始化模型计算力场的时候,由于要考虑到DNA分子的刚性,所以在DNA链上必须要引入键角张力,其势能函数与弹簧振子的弹性势能一样,不过将距离换成键角,而通过粗粒化模型我们只知道相邻三个分子的三维空间坐标,现在问题来了,因为力是势能函数对位移的一阶负倒数,虽然可以通过余弦定理将键角张力势能函数中的键角转换成位移,可是如何将每个原子的受力求解出来,请神人赐教。 |
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3楼2013-09-23 14:50:18
sciencejoy
新虫 (著名写手)
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2楼2013-09-23 09:56:55
fhh2626
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4楼2013-09-23 15:35:14

5楼2013-09-23 17:05:23







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