24小时热门版块排行榜    

查看: 1208  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

后悔无期

金虫 (小有名气)

[求助] 扩内含子

有完整的CDS区大约1000bp,想要扩内含子,分三段,分两段都试过,设计了好多对引物就是扩不出条带!巣式PCR也做了,扩出来的条带不是想要的! 在数据库中也找不到其他物种该基因的DNA序列! 我该如何是好,请大侠们指点!多谢
回复此楼
别回忆,因为回不去。把眼泪留给最疼你的人,把微笑留给伤你最深的人。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sj082csh

银虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-13 18:09:16
1.研究对象是动物吗?多组合几对引物跑跑看,会不会正好引物之间没有内含子? 2.跑gDNA的时候,另外也需用cDNA跑跑看,做个对照哈。

[ 发自小木虫客户端 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2013-09-29 08:00:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

王希望

铁杆木虫 (正式写手)

换个生物公司的酶试试
2楼2013-09-24 16:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-29 10:15:07
后悔无期: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-10-12 11:22:41
gyesang: 回帖置顶 2013-10-12 12:20:59
1.内含子存在于基因组DNA中,因此必须以基因组DNA为模板扩增。
2.在cDNA的5‘端和3’端设计一对引物,争取1次就将包含内含子的基因序列扩增出来。
3.尝试一下不同的退火和延伸时间,因为你并不知道你的基因的序列长度。
4.如果用fermentas的超保真酶扩增的话,延伸时间设定依据是:2kb/min

仅供参考。
4楼2013-09-29 08:46:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

后悔无期

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by sj082csh at 2013-09-29 08:00:13
1.研究对象是动物吗?多组合几对引物跑跑看,会不会正好引物之间没有内含子? 2.跑gDNA的时候,另外也需用cDNA跑跑看,做个对照哈。

是植物,分三段,扩出来片段了!
别回忆,因为回不去。把眼泪留给最疼你的人,把微笑留给伤你最深的人。
5楼2013-10-12 11:25:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见