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jpzou

木虫 (正式写手)

[交流] platon 检查中的几个错误,请高手帮忙看看,谢谢!

432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O25    ..  C16      =       2.91 Ang.
#===============================================================================
432_ALERT_2_C Short Inter X...Y Contact  O25    ..  C11      =       2.97 Ang.
764_ALERT_4_C Overcomplete CIF Bond list Detected (Rep/Expd) .       1.14 Ratio
790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          2
              H2 O
790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          3
              H2 O
790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          4
              O
#===============================================================================

这些错误怎么解决,谢谢!
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jpzou

木虫 (正式写手)

楼上的兄弟,解决了,谢谢!
版主能否帮我给gujm516加3个金币,谢谢!
13楼2007-11-30 15:33:45
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chemeuro

银虫 (正式写手)

check cif 下,看是几类错误
2楼2007-11-25 14:46:36
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gujm516

金虫 (小有名气)

432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O25    ..  C16      =       2.91 Ang.
432_ALERT_2_C Short Inter X...Y Contact  O25    ..  C11      =       2.97 Ang.
可以用距离约束的办法

764_ALERT_4_C Overcomplete CIF Bond list Detected (Rep/Expd) .       1.14 Ratio
可能BOND列表有重复

790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          2
              H2 O
790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          3
              H2 O
790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          4
              O
说明这些原子不在同一分子套里,把他们平移进来就可以了。
3楼2007-11-25 21:43:43
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jpzou

木虫 (正式写手)

楼上的兄弟,前面两个错误我知道是氢键的问题,但不是你所说的那么简单的问题。在ins文件中加入htab命令以及通过platon软件找氢键的方法都没找到这两个氢键,但是检查出现上述错误,不知何原因。
对于错误764_ALERT_4_C为什么会产生呢,能告诉我原因和解决办法吗?
另外最后三个错误用简单的平移命令能解决吗?
望告知,谢谢!
4楼2007-11-25 23:18:26
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