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33ggdf

新虫 (小有名气)

[求助] Sac1和Xho1的双酶切连接

我在做Sac1和Xho1的双酶切连接,分别用这两个酶对表达载体和T载体进行双酶切3h(NEB的酶 ),T载体上我还加了保护碱基,然后分别切胶回收表达载体的大片段和T载体上的目的片段(两个片段都很亮,大小也合适,大片段约16k,目的片段1100bp),大片段浓度是150纳克/微升,小片段是33纳克/微升,然后做连接(连接是用的promega的T4连接酶,16度16小时 22度3小时 4度过夜都试过),共20微升体系(2微升连接酶,2微升10×连接buffer, 共做了三个比例即大片段与目的片段两者的摩尔比是1:6  1:10   和1:15),再进行热击转化涂皿,分别做了阳性对照即空载体(长很多单菌落)和阴性对照(无单菌落)可以证明感受态及转化过程没问题,双酶切也成功。可为什么我的连接反应却一个单菌落也长不出来呢(抗性和浓度也没问题),哪位高人帮帮忙???最近快烦死了。。。。。
还有几个疑问:
                    1 难道是我的载体和片段的浓度不高还是太高,浓度是多少才合适呢?
                    2 不好连接是不是因为我的载体太大的原因
                    3 难道要我分步酶切吗?
                    4 求帮助啊啊啊。。。
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白菜吃虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
33ggdf: 金币+2 2013-09-25 20:48:16
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2013-09-26 15:07:45
gyesang: 回帖置顶 2013-09-26 15:07:47
1. 分别用这两个酶做下单酶切验证,包括载体和片段,确定酶切位点没有问题。
2. 如果确定酶切没有问题,双酶切回收后的产物用1—2ul 跑下电泳看下,片段是否回收。
3. 鉴于载体片段很大,因此可以再加大小片段的量,提高比例到1:100都没问题(浓缩下片段)。另外换个酶连接,防止酶失效。
4. 在后期鉴定的时候最好在载体两端找引物进行PCR鉴定,或者找载体上的酶切位点鉴定,防止多拷贝插入。
5. 建议加一个载体片段自连的阴性对照。
6楼2013-09-25 19:07:43
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