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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 不知道我这个体系能不能模拟
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ZTB爱化学

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-09-09 15:54:16
http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%98%BF%E4%BC%A6%E5%B0%BC%E4%B9%8C%E6%96%AF%E6%96%B9%E7%A8%8B...

不知道您能不能在模拟上给一定的帮助呢？
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好好科研
11楼2013-09-09 22:51:27
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Voland

金虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by ZTB爱化学 at 2013-09-09 22:50:31
真是丢人了，非常感谢。但是如果我要模拟两个反应的路径得到活化能的话一般需要反应物什么样的参数呢？用什么软件模拟比较合适呢？具体过程是怎样的呢？您要是能帮我解决这个问题，给多少金币都行...

反应进行速率的问题，如果是从活化能方向去弄，那我知道的只有Gaussian咯，不过那不是模拟是计算呢。需要得到一个过渡态结构然后通过各种方法（扫势能面或者IRC等等）来证明这个过渡态结构的正确性……没那么容易的啦，过渡态问题在Gaussian是重头戏，没有经验不是内行很难，要是你的体系很大，随手一个B3LYP/6-31+G*基函数数量就超过1000……能做的可能性就更小了……（换其他基组方法不好说，问题是，审稿人能否信服咯？）至于模拟的话，MS中的DMol3和CASTEP好像可以做过渡态，具体我没用过，你得自己找找看。
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Yağma！Yağma！Yağma！
12楼2013-09-09 23:29:10
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ZTB爱化学

银虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by Voland at 2013-09-09 23:29:10
反应进行速率的问题，如果是从活化能方向去弄，那我知道的只有Gaussian咯，不过那不是模拟是计算呢。需要得到一个过渡态结构然后通过各种方法（扫势能面或者IRC等等）来证明这个过渡态结构的正确性……没那么容易的 ...

不过我这两个都是沉淀反应，反应速率都很快，所以没法实验去测，这种快反应可能有过渡态吗？对这个不是很了解
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好好科研
13楼2013-09-10 08:47:51
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Voland

金虫 (小有名气)
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13楼: Originally posted by ZTB爱化学 at 2013-09-10 08:47:51
不过我这两个都是沉淀反应，反应速率都很快，所以没法实验去测，这种快反应可能有过渡态吗？对这个不是很了解...

理论上可以啊……除非你那个反应不符合阿伦尼乌斯定律的要求，但是能和可以做还是有很远的距离的，建议你找一个搞Gaussian计算的和他讨论一下，清华大学的话，帅志刚吧，好像他是这块的。
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Yağma！Yağma！Yağma！
14楼2013-09-10 13:55:55
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
ZTB爱化学: 金币+6, ★★★很有帮助 2013-09-13 16:35:54
引用回帖:
9楼: Originally posted by ZTB爱化学 at 2013-09-09 22:50:31
真是丢人了，非常感谢。但是如果我要模拟两个反应的路径得到活化能的话一般需要反应物什么样的参数呢？用什么软件模拟比较合适呢？具体过程是怎样的呢？您要是能帮我解决这个问题，给多少金币都行...

活化能用gaussian计算就行了 去高斯官网上面找thermochemistry in gaussian看看吧

搞科研，一两个月没有进展正常得很，不过只要用心的做～最后肯定能成功的
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15楼2013-09-13 11:01:29
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ZTB爱化学

银虫 (正式写手)
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15楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-09-13 11:01:29
活化能用gaussian计算就行了 去高斯官网上面找thermochemistry in gaussian看看吧

搞科研，一两个月没有进展正常得很，不过只要用心的做～最后肯定能成功的...

非常感谢。难倒不是很怕，就怕方向给弄错了我还是想咨询下您，沉淀反应确定是可以用gaussian算活化能吗？假设两个反应的活化能都算出来了，但是指前因子没有，好像还是不能比较两个反应的快慢啊？
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好好科研
16楼2013-09-13 16:06:07
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ZTB爱化学

银虫 (正式写手)
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15楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-09-13 11:01:29
活化能用gaussian计算就行了 去高斯官网上面找thermochemistry in gaussian看看吧

搞科研，一两个月没有进展正常得很，不过只要用心的做～最后肯定能成功的...

突然还有个问题就是计算活化能必然是有过渡态的，不然没法说活化能，这个活化能该怎么确定呢？不是做理论计算的，所以真的完全不懂，希望能和您进一步交流交流啊
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好好科研
17楼2013-09-13 16:34:06
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