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1075460936铜虫 (小有名气)
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Sample Text 各位大神，小弟有个关于高斯计算中优化离子型分子的问题。在此以氯化铵的分子结构优化为例，在gview中画出铵离子和氯离子后，提交高斯运算时需要用fragment来定义分子片段铵离子的电荷+1和氯离子-1吗，还是直接提交计算就行了？两种计算结果在gview中查看电荷分布是一样的。直接提交计算会不会把离子当成自由基来计算？在高斯说明书上没看懂fragment的含义  。跪求解答。。。 |
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【答案】应助回帖
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氯化铵的计算，本不必作为分子片来计算的。这时是无温度、气相的情形。这时它只是个极性分子，象你现在计算的那样。 铵离子和氯离子的概念，是在水中的，形成铵水合离子和氯水合离子。 优化离子型分子要小心，要看是否可以忽略掉溶剂水的计算（显式或隐式），不要把忽略水存在的计算，当成想像中的有水的离子情形。 纯分子计算出的性质是分子的内因，水是外因，外因通过内因起作用。起作用到什么程度，是否影响到你所观察到的分子性质，决定你是否需要考虑溶剂水的计算。考虑溶剂水的计算难度较大。 |
2楼2013-09-08 14:14:34
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谢谢您，不好意思，还有个问题，就是关于gview中画这种分子，gview中是不分离子，自由基的吧，需要在gauss输入文件中写出电荷，但是这种包含正负离子的分子本身是0电荷的，输入文件就是0,1，如何保证gauss是按照离子还是自由基计算的呢，正负离子的电荷要如何表示在输入文件中呢？（以氯化铵为例） # opt hf/3-21g geom=connectivity Title Card Required 0 1 Cl -3.83720934 -0.20930232 0.00000000 N -0.11627907 0.02325581 0.00000000 H 0.21704252 -0.91955738 0.00000000 H 0.21706013 0.49465618 0.81649658 H 0.21706013 0.49465618 -0.81649658 H -1.11627907 0.02326826 -0.00000000 是否是这样的呢？ 不好意思，麻烦您了！ |
5楼2013-09-09 10:50:57
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