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怒冲星河

木虫 (正式写手)

11楼2013-09-09 14:51:43
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cswithme

银虫 (小有名气)

你把phonon*.CASTEP那个文件的内容帖出来
12楼2013-09-10 10:58:55
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by cswithme at 2013-09-10 10:58:55
你把phonon*.CASTEP那个文件的内容帖出来

Ni3Pt_PhonDOS.castep:

Job started on host NGZVDWXG9UJWYWE
at Fri Sep  6 21:25:53 2013

+-------------------------------------------------+
|                                                 |
|      CCC   AA    SSS  TTTTT  EEEEE  PPPP        |
|     C     A  A  S       T    E      P   P       |
|     C     AAAA   SS     T    EEE    PPPP        |
|     C     A  A     S    T    E      P           |
|      CCC  A  A  SSS     T    EEEEE  P           |
|                                                 |
+-------------------------------------------------+
|                                                 |
| Welcome to Materials Studio CASTEP version 6.0  |
| Ab Initio Total Energy Program                  |
|                                                 |
| Authors:                                        |
| M. Segall, M. Probert, C. Pickard, P. Hasnip,   |
| S. Clark, K. Refson, J. R. Yates, M. Payne      |
|                                                 |
| Contributors:                                   |
| P. Lindan, P. Haynes, J. White, V. Milman,      |
| N. Govind, M. Gibson, P. Tulip, V. Cocula,      |
| B. Montanari, D. Quigley, M. Glover,            |
| L. Bernasconi, A. Perlov, M. Plummer,           |
| E. McNellis, J. Meyer, J. Gale, D. Jochym       |
| J. Aarons, B. Walker                            |
|                                                 |
| Copyright (c) 2000 - 2011                       |
|                                                 |
| Please cite                                     |
|                                                 |
|     "First principles methods using CASTEP"     |
|                                                 |
|         Zeitschrift fuer Kristallographie       |
|           220(5-6) pp. 567-570 (2005)           |
|                                                 |
| S. J. Clark, M. D. Segall, C. J. Pickard,       |
| P. J. Hasnip, M. J. Probert, K. Refson,         |
| M. C. Payne                                     |
|                                                 |
|       in all publications arising from          |
|              your use of CASTEP                 |
|                                                 |
+-------------------------------------------------+


This version was compiled for i686-windows-msvc2008 on Dec 08 2011

License checkout of MS_castep successful

+-------------------------------------------------+
|                                                 |
|  D D D D    F F F F F  P P P P     T T T T T    |
|  D       D  F          P       P       T        |
|  D       D  F F F F    P P P P         T        |
|  D       D  F          P               T        |
|  D D D D    F          P               T        |
|                                                 |
+-------------------------------------------------+
|                                                 |
| Welcome to Castep Linear Response (DFPT)        |
|                                                 |
| Copyright (c) 2006 - 2011                       |
|                                                 |
| Please cite the following publications in all   |
| work arising from your use of CASTEP LR.        |
|                                                 |
| K. Refson, S. J. Clark and P. R. Tulip          |
| Variational density functional perturbation     |
| theory for dielectrics and lattice dynamics     |
| Phys. Rev. B 73(15), 155114 (2006)              |
+-------------------------------------------------+

Reading continuation data from model file Ni3Pt_PhonDOS.check

Pseudo atomic calculation performed for Ni 3s2 3p6 3d8 4s2

Converged in 39 iterations to a total energy of -4270.8633 eV


Pseudo atomic calculation performed for Pt 5d9 6s1

Converged in 28 iterations to a total energy of -716.8235 eV

Initialising basis set for model.
Reinitialising basis set for current geometry.
Continuing from previous run with ground state wavefunction.
Continuing from previous run with ground state density.
Info: BACKUP_INTERVAL modified from          0 to        900
Info: BS_WRITE_EIGENVALUES modified from T to F
Info: PHONON_ENERGY_TOL modified from    0.100000E-04 eV/A**2 to     100000.     eV/A**2
Info: PHONON_FORCE_CONSTANT_CUTOFF modified from     0.00000     A to     5.07624     A
Info: PHONON_FINE_METHOD modified from NONE to supercell
Info: PHONON_METHOD modified from LINEARRESPONSE to finitedisplacement
Info: PHONON_CALC_LO_TO_SPLITTING modified from T to F
Info: CALCULATE_BORN_CHARGES modified from T to F
Calculation not parallelised.

************************************ Title ************************************
CASTEP calculation from Materials Studio

***************************** General Parameters ******************************
  
output verbosity                               : normal  (1)
continuing from                                : Ni3Pt_PhonDOS.check
write checkpoint data to                       : Ni3Pt_PhonDOS.check
type of calculation                            : phonon calculation
stress calculation                             : off
density difference calculation                 : off
electron localisation func (ELF) calculation   : off
Hirshfeld analysis                             : off
unlimited duration calculation
timing information                             : on
memory usage estimate                          : on
write final potential to formatted file        : off
write final density to formatted file          : off
write BibTeX reference list                    : on
  
output         length unit                     : A
output           mass unit                     : amu
output           time unit                     : ps
output         charge unit                     : e
output         energy unit                     : eV
output          force unit                     : eV/A
output       velocity unit                     : A/ps
output       pressure unit                     : GPa
output     inv_length unit                     : 1/A
output      frequency unit                     : cm-1
output force constant unit                     : eV/A**2
output         volume unit                     : A**3
output   IR intensity unit                     : (D/A)**2/amu
output         dipole unit                     : D
output         efield unit                     : eV/A/e
output        entropy unit                     : J/mol/K
  
wavefunctions paging                           : none
data distribution                              : optimal for this architecture
optimization strategy                          : balance speed and memory

*********************** Exchange-Correlation Parameters ***********************
  
using functional                               : Perdew Burke Ernzerhof
Divergence correction                          : off
DFT+D: Semi-empirical dispersion correction    : off

************************* Pseudopotential Parameters **************************
  
pseudopotential representation                 : reciprocal space
<beta|phi> representation                      : reciprocal space

**************************** Basis Set Parameters *****************************
  
plane wave basis set cut-off                   :   860.0000   eV
finite basis set correction                    : none

**************************** Electronic Parameters ****************************
  
number of  electrons                           :  64.00   
net charge of system                           :  0.000   
net spin   of system                           :  0.000   
number of  up  spins                           :  32.00   
number of down spins                           :  32.00   
treating system as non-spin-polarized
number of bands                                :         39

********************* Electronic Minimization Parameters **********************
  
Method: Treating system as metallic with density mixing treatment of electrons,
         and number of  SD  steps               :          1
         and number of  CG  steps               :          4
  
total energy / atom convergence tol.           : 0.5000E-06   eV
eigen-energy convergence tolerance             : 0.5128E-07   eV
max force / atom convergence tol.              : ignored
convergence tolerance window                   :          3   cycles
max. number of SCF cycles                      :        100
number of fixed-spin iterations                :         10
smearing scheme                                : Gaussian
smearing width                                 : 0.1000       eV
Fermi energy convergence tolerance             : 0.5128E-08   eV

************************** Density Mixing Parameters **************************
  
density-mixing scheme                          : Pulay
max. length of mixing history                  :         20
charge density mixing amplitude                : 0.5000   
cut-off energy for mixing                      :  860.0       eV

****************************** Phonon Parameters ******************************
  
phonon calculation method                      : finite displacement
finite displacement amplitude                  : 0.5292E-02   A
fine phonon calculation method                 : supercell
non-periodic force constant method             : Weighted cumulant sum
LO/TO splitting term                           : not included
acoustic phonon sum rule                       : correct D(q) in recip-space
Born effective charges                         : not calculated
Raman intensities                              : not calculated
phonon k-points                                : use reduced set
phonon DOS                                     : not calculated
backups results every                          :        900   seconds
band convergence tolerance                     : 0.1000E-05   eV

*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   3.5930392   0.0000000   0.0000000        1.7487105   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   3.5930392   0.0000000        0.0000000   1.7487105   0.0000000
   0.0000000   0.0000000   3.5930392        0.0000000   0.0000000   1.7487105

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    3.593039          alpha =   90.000000
                    b =    3.593039          beta  =   90.000000
                    c =    3.593039          gamma =   90.000000

                       Current cell volume =   46.385888       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =    4
                      Total number of species in cell =    2
                        Max number of any one species =    3

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  Ni           1         0.000000   0.500000   0.500000   x
            x  Ni           2         0.500000   0.000000   0.500000   x
            x  Ni           3         0.500000   0.500000   0.000000   x
            x  Pt           1         0.000000   0.000000   0.000000   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx


                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    Ni   58.7099991
                                    Pt  195.0899963

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    Ni    0.1620000 Isotope 61
                                    Pt    1.0000000 No Isotope Defined

                          Files used for pseudopotentials:
                                    Ni Ni_00PBE_OP.recpot
                                    Pt Pt_00PBE_OP.recpot

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  6  6  6
                         Number of kpoints used =          10

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1   0.416667   0.416667   0.416667   0.0370370  +
             +     2   0.416667   0.416667   0.250000   0.1111111  +
             +     3   0.416667   0.416667   0.083333   0.1111111  +
             +     4   0.416667   0.250000   0.250000   0.1111111  +
             +     5   0.416667   0.250000   0.083333   0.2222222  +
             +     6   0.416667   0.083333   0.083333   0.1111111  +
             +     7   0.250000   0.250000   0.250000   0.0370370  +
             +     8   0.250000   0.250000   0.083333   0.1111111  +
             +     9   0.250000   0.083333   0.083333   0.1111111  +
             +    10   0.083333   0.083333   0.083333   0.0370370  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

                      Number of symmetry operations   =          48
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry =  0.00000         ANG
               Point group of crystal =    32: Oh, m-3m, 4/m -3 2/m
           Set iprint > 1 for details on symmetry rotations/translations

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 5
                         Cell constraints are:  1 1 1 0 0 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
                                                                        
              The requested supercell has been generated                 
                                                                        

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   7.1860784   7.1860784   0.0000000        0.4371776   0.4371776  -0.4371776
   7.1860784   0.0000000   7.1860784        0.4371776  -0.4371776   0.4371776
   0.0000000   7.1860784   7.1860784       -0.4371776   0.4371776   0.4371776

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =   10.162650          alpha =   60.000000
                    b =   10.162650          beta  =   60.000000
                    c =   10.162650          gamma =   60.000000

                       Current cell volume =  742.174206       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =   64
                      Total number of species in cell =    2
                        Max number of any one species =   48

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  Ni           1         0.000000   0.000000   0.250000   x
            x  Ni           2         0.000000   0.250000   0.000000   x
            x  Ni           3         0.250000   0.000000   0.000000   x
            x  Ni           4         0.500000   0.000000   0.250000   x
            x  Ni           5         0.500000   0.250000   0.000000   x
            x  Ni           6         0.750000   0.000000   0.000000   x
            x  Ni           7         0.000000   0.500000   0.250000   x
            x  Ni           8         0.000000   0.750000   0.000000   x
            x  Ni           9         0.250000   0.500000   0.000000   x
            x  Ni          10         0.000000   0.000000   0.750000   x
            x  Ni          11         0.000000   0.250000   0.500000   x
            x  Ni          12         0.250000   0.000000   0.500000   x
            x  Ni          13         0.250000   0.250000   0.500000   x
            x  Ni          14         0.250000   0.500000   0.250000   x
            x  Ni          15         0.500000   0.250000   0.250000   x
            x  Ni          16         0.500000   0.500000   0.250000   x
            x  Ni          17         0.500000   0.750000   0.000000   x
            x  Ni          18         0.750000   0.500000   0.000000   x
            x  Ni          19         0.500000   0.000000   0.750000   x
            x  Ni          20         0.500000   0.250000   0.500000   x
            x  Ni          21         0.750000   0.000000   0.500000   x
            x  Ni          22         0.750000   0.250000   0.500000   x
            x  Ni          23         0.750000   0.500000   0.250000   x
            x  Ni          24         0.000000   0.250000   0.250000   x
            x  Ni          25         0.000000   0.500000   0.750000   x
            x  Ni          26         0.000000   0.750000   0.500000   x
            x  Ni          27         0.250000   0.500000   0.500000   x
            x  Ni          28         0.250000   0.750000   0.500000   x
            x  Ni          29         0.250000   0.000000   0.250000   x
            x  Ni          30         0.500000   0.750000   0.250000   x
            x  Ni          31         0.250000   0.250000   0.000000   x
            x  Ni          32         0.250000   0.500000   0.750000   x
            x  Ni          33         0.500000   0.250000   0.750000   x
            x  Ni          34         0.500000   0.500000   0.750000   x
            x  Ni          35         0.500000   0.750000   0.500000   x
            x  Ni          36         0.750000   0.500000   0.500000   x
            x  Ni          37         0.750000   0.750000   0.500000   x
            x  Ni          38         0.750000   0.000000   0.250000   x
            x  Ni          39         0.000000   0.750000   0.250000   x
            x  Ni          40         0.750000   0.250000   0.000000   x
            x  Ni          41         0.750000   0.500000   0.750000   x
            x  Ni          42         0.000000   0.250000   0.750000   x
            x  Ni          43         0.250000   0.750000   0.000000   x
            x  Ni          44         0.250000   0.000000   0.750000   x
            x  Ni          45         0.500000   0.750000   0.750000   x
            x  Ni          46         0.750000   0.750000   0.000000   x
            x  Ni          47         0.750000   0.000000   0.750000   x
            x  Ni          48         0.000000   0.750000   0.750000   x
            x  Pt           1         0.000000   0.000000   0.000000   x
            x  Pt           2         0.500000   0.000000   0.000000   x
            x  Pt           3         0.000000   0.500000   0.000000   x
            x  Pt           4         0.000000   0.000000   0.500000   x
            x  Pt           5         0.250000   0.250000   0.250000   x
            x  Pt           6         0.500000   0.500000   0.000000   x
            x  Pt           7         0.500000   0.000000   0.500000   x
            x  Pt           8         0.750000   0.250000   0.250000   x
            x  Pt           9         0.000000   0.500000   0.500000   x
            x  Pt          10         0.250000   0.750000   0.250000   x
            x  Pt          11         0.250000   0.250000   0.750000   x
            x  Pt          12         0.500000   0.500000   0.500000   x
            x  Pt          13         0.750000   0.750000   0.250000   x
            x  Pt          14         0.750000   0.250000   0.750000   x
            x  Pt          15         0.250000   0.750000   0.750000   x
            x  Pt          16         0.750000   0.750000   0.750000   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx


                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    Ni   58.7099991
                                    Pt  195.0899963

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    Ni    0.1620000 Isotope 61
                                    Pt    1.0000000 No Isotope Defined

                          Files used for pseudopotentials:
                                    Ni Ni_00PBE_OP.recpot
                                    Pt Pt_00PBE_OP.recpot

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  2  2  2
                         Number of kpoints used =           2

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1  -0.250000  -0.250000  -0.250000   0.2500000  +
             +     2   0.250000  -0.250000   0.250000   0.7500000  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

                      Number of symmetry operations   =         768
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry =  0.00000         ANG
               Point group of crystal =    32: Oh, m-3m, 4/m -3 2/m
           Set iprint > 1 for details on symmetry rotations/translations

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 5
                         Cell constraints are:  1 1 1 0 0 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
************************************************************************
   The memory required for this calculation exceeds machine capacity.

           Unable to continue. Run will be ABORTED.

    Suggestions:
      Check the run setup is reasonable; in particular cell dimensions,
      number of atoms, plane wave cutoff all affect memory consumption.

      Investigate the parameters "opt_strategy"/"opt_strategy_bias" and
      "page_wvfns" which may be used to reduce memory requirements.

      If the calculation is being run on a distributed memory computer
      consider increasing the number of processors.

      It may be necessary to run this calculation on another computer
      with more RAM or upgrade the physical RAM on the current system.
************************************************************************

Information for developers:
ALLOCATE request failed for array "temp_coeffs" in routine "wave_beta_phi_wv_ks"
Current trace stack:
wave_beta_phi_wv_ks
wave_calc_Soverlap_wv_ks
wave_Sorthonormalise_wv_ks
wave_Sorthonormalise_wv
wave_initialise_wv
phonon_force_constant_matrix
phonon_calculate
castep
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
13楼2013-09-10 11:30:34
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 怒冲星河 at 2013-09-10 11:30:34
Ni3Pt_PhonDOS.castep:

Job started on host NGZVDWXG9UJWYWE
at Fri Sep  6 21:25:53 2013

+-------------------------------------------------+
|                                                ...

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  • 附件 1 : Ni3Pt_PhonDOS.castep.txt
  • 2013-09-10 11:34:08, 24.81 K
14楼2013-09-10 11:34:47
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cswithme

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
怒冲星河: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2013-09-11 08:53:13
在你的Ni3Pt_PhonDOS.castep文件中很明确的写出了原因:
   The memory required for this calculation exceeds machine capacity.

           Unable to continue. Run will be ABORTED.
15楼2013-09-10 20:27:19
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

引用回帖:
15楼: Originally posted by cswithme at 2013-09-10 20:27:19
在你的Ni3Pt_PhonDOS.castep文件中很明确的写出了原因:
   The memory required for this calculation exceeds machine capacity.

           Unable to continue. Run will be ABORTED.

这个意思是说内存不足吗?
16楼2013-09-10 21:41:52
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cswithme

银虫 (小有名气)

引用回帖:
16楼: Originally posted by 怒冲星河 at 2013-09-10 21:41:52
这个意思是说内存不足吗?...

是的
17楼2013-09-11 08:19:40
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by cswithme at 2013-09-11 08:19:40
是的...

明白了,非常感谢
18楼2013-09-11 08:51:55
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liangpei

木虫 (职业作家)

你这个使用的是哪个版本啊,版本不同貌似有些地方设置也不一样吧!
19楼2013-10-18 17:28:03
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tsglss

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by mengfc at 2013-09-08 23:47:21
内存不足。几个原子的体系算声子谱都得二十多个G内存。

几个原子的体系算声子谱都得二十多个G内存?
做好自己
20楼2014-10-27 20:51:38
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