应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 系统发育树构建中的若干问题
51/1返回列表
查看: 1877  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lhf903

金虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树构建中的若干问题

这两天在忙系统发育树的构建，有一些问题弄不清楚，特来请教。
     我从文献中的发育树上找了一些菌株作为参照，觉得找的已经足够多了，但还是不能把我自己的序列都包括进去。还有数字的大小代表什么，太小是不是亲缘关系较远~
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2013-09-05 19:52:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
第一次建树，还有许多问题不很清楚，望有经验的虫子可以给点意见~
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2013-09-07 13:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lhf903: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-09-06 11:04:22
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-09-06 11:47:59
构建系统发育树首先要将你的序列放到NCBI和数据库中序列比对，去同源性高的（比如>95%，根据实际情况）建树，不是从文献中获得序列
外围典型种可以在专门网站搜到，并获得他的基因组序列
树枝上的数值是说明其两个菌株在进化关系上相近的一种运用计算得到的值，一般>73的树枝表示两株菌同源可信
赞一下 回复此楼
兴趣是第一导师，我爱它，因此我毫无疲倦的探索
2楼2013-09-06 10:27:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-09-06 10:27:02
构建系统发育树首先要将你的序列放到NCBI和数据库中序列比对，去同源性高的（比如>95%，根据实际情况）建树，不是从文献中获得序列
外围典型种可以在专门网站搜到，并获得他的基因组序列
树枝上的数值是说明其 ...

建树的序列不是应该用自己的序列嘛，可以取NCBI比对后的同源性高的序列吗
赞一下 回复此楼
3楼2013-09-06 11:07:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-09-06 10:27:02
构建系统发育树首先要将你的序列放到NCBI和数据库中序列比对，去同源性高的（比如>95%，根据实际情况）建树，不是从文献中获得序列
外围典型种可以在专门网站搜到，并获得他的基因组序列
树枝上的数值是说明其 ...

我目前不了解外围典型种的网站，可否告知一些较权威的~
赞一下 回复此楼
4楼2013-09-06 11:10:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭