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lhf903金虫 (正式写手)
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系统发育树构建中的若干问题
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这两天在忙系统发育树的构建，有一些问题弄不清楚，特来请教。 我从文献中的发育树上找了一些菌株作为参照，觉得找的已经足够多了，但还是不能把我自己的序列都包括进去。还有数字的大小代表什么，太小是不是亲缘关系较远~ |
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hkqgeoffrey
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http://www.bacterio.cict.fr/ 我用的是师兄告知的这个网站，其他的没用过，你试试看吧 |
8楼2013-09-07 10:37:35
hkqgeoffrey
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构建系统发育树首先要将你的序列放到NCBI和数据库中序列比对，去同源性高的（比如>95%，根据实际情况）建树，不是从文献中获得序列 外围典型种可以在专门网站搜到，并获得他的基因组序列 树枝上的数值是说明其两个菌株在进化关系上相近的一种运用计算得到的值，一般>73的树枝表示两株菌同源可信 |
2楼2013-09-06 10:27:02
lhf903
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3楼2013-09-06 11:07:17
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4楼2013-09-06 11:10:28
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