| 查看: 2166 | 回复: 14 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
lhf903金虫 (正式写手)
|
[求助]
系统发育树构建中的若干问题
|
||
|
这两天在忙系统发育树的构建，有一些问题弄不清楚，特来请教。 我从文献中的发育树上找了一些菌株作为参照，觉得找的已经足够多了，但还是不能把我自己的序列都包括进去。还有数字的大小代表什么，太小是不是亲缘关系较远~ |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有184人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
hkqgeoffrey
金虫 (小有名气)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 1351.4
- 散金: 3
- 红花: 2
- 帖子: 135
- 在线: 45.4小时
- 虫号: 2546967
- 注册: 2013-07-15
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lhf903: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-09-07 12:47:46
lhf903: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-09-27 10:02:27
lhf903: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-09-07 12:47:46
lhf903: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-09-27 10:02:27
|
http://www.bacterio.cict.fr/ 我用的是师兄告知的这个网站，其他的没用过，你试试看吧 |
8楼2013-09-07 10:37:35
hkqgeoffrey
金虫 (小有名气)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 1351.4
- 散金: 3
- 红花: 2
- 帖子: 135
- 在线: 45.4小时
- 虫号: 2546967
- 注册: 2013-07-15
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lhf903: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-09-06 11:04:22
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-09-06 11:47:59
感谢参与，应助指数 +1
lhf903: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-09-06 11:04:22
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-09-06 11:47:59
|
构建系统发育树首先要将你的序列放到NCBI和数据库中序列比对，去同源性高的（比如>95%，根据实际情况）建树，不是从文献中获得序列 外围典型种可以在专门网站搜到，并获得他的基因组序列 树枝上的数值是说明其两个菌株在进化关系上相近的一种运用计算得到的值，一般>73的树枝表示两株菌同源可信 |
2楼2013-09-06 10:27:02
lhf903
金虫 (正式写手)
- 应助: 39 (小学生)
- 金币: 3777.5
- 散金: 1020
- 红花: 2
- 帖子: 360
- 在线: 328.9小时
- 虫号: 1910016
- 注册: 2012-07-25
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2013-09-06 11:07:17
lhf903
金虫 (正式写手)
- 应助: 39 (小学生)
- 金币: 3777.5
- 散金: 1020
- 红花: 2
- 帖子: 360
- 在线: 328.9小时
- 虫号: 1910016
- 注册: 2012-07-25
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
4楼2013-09-06 11:10:28
投票:
5