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Voland金虫 (小有名气)
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MS-Sorption 模块模拟的FH势量子效应和μPT系综求助
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大家好……本人使用MS-Sorption模块已经有一段时间……最近被两个问题卡住了，在这里提出来，希望能够得到各位高手的解答。 1. 77K下计算N2或者H2的吸附量（三原子模型），在低压（例如10^6 Kpa）出现比实验值偏大的情况，我觉得大概是没有考虑量子效应的原因，我听说Sorption似乎并不能做FH势的校正……但是又苦于不精确，想问一下有什么办法可以做到？（如果是调整Dreiding力场中函数表达式的话，我看了很久的文件还是没找到那个势能函数表达式在哪里……）如果Sorption不能做，那有什么比较容易学的软件能够针对量子效应做出校正？ 2. 有一些结构会出现所谓Breathing的现象，即是在实验中会发生框架结构的有序形变，导致框架体积变化，这里如果按照Sorption所给的μVT巨正则系综来算，会有些不足。想请教一下，Sorption模块是否能做μPT系综？如果不行，是否是在得到一个吸附后的结构后，再使用Forcite使用分子动力学的方法计算μPT系综，最后得到结构再进行下一步的μVT巨正则MC模拟呢？ 还望各位能予以回答，拜谢。 |
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送红花一朵 |
首先，你说的这个类似于接力的方法是可行的，并且很多时候的确是这么做，尤其在吸附量大的时候可以大量地节省时间。 其次你说的波动情况显然是你计算步数太少导致的，不知道你的体系是怎样的，选择的步数又是多少。根据我的经验，吸附量越大，计算所需的步数越多。比如一般的mof，3000万左右的步数可以很好的降低误差。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
15楼2013-09-25 10:47:56
2楼2013-09-05 00:57:32
Voland
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1. 这样啊……没关系……谢谢应助…… 2. ……的确压力是不变的，但是这并不是μPT系综呢……至少体积是不变的，而我需要的是柔性的框架结构下的MC模拟……看到有文献用DL_POLY做了，所用的模拟为Gibbs Ensemble Monte Carlo模拟，能够动态地一边进行框架结构形状计算和吸附模拟。我想找的方法是……到底MS能不能做？如果不能，是不是我所猜想的那个比较麻烦的方法才能做呢？ P.S. GEMC模拟相关文献如附件。 |
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