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eastlife

禁虫 (初入文坛)

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小仆人

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

top file  自己制作, 按照其他top的模板, 改里面的东西就可以了

先用genbox 做一个水分子的盒子
再用genbox 插入你想插入的分子, 一切搞定
Jesus shall take the highest honor
12楼2013-10-07 08:52:25
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、不知道语句怎么编写 ,你应该去仔细阅读手册啊。
2、据我所知,没有自带的“醇、乙醇、尿素的结构”,不过这些小分子你可以直接找到他们的PDB 文件和力场参数,具体的混合你可以试试packmol,一个很小但是很好用的建模软件
2楼2013-08-27 15:58:05
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
溶剂分子一个一个加就是了:
1. 做出水箱
2. 向水箱里插入一种溶剂
3. 再向2所得溶液插入另一种溶剂
.....
genbox有-i选项
3楼2013-08-28 08:00:49
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eastlife

禁虫 (初入文坛)

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4楼2013-08-28 21:54:51
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