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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于扭转角和二面角的计算
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

[求助] 关于扭转角和二面角的计算

现有晶体中所有原子的坐标数据，想通过编程，计算相邻甲烷分子中C-H----C-H的扭转角或二面角，
希望有相关经验的高手指教
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自古明王圣帝，犹须勤学，况凡庶乎！
1楼 2013-08-21 08:56:16
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dreamfly_ykf: 金币+5, 请帮组列出具体的方程 2013-08-23 09:27:31
有三个点可以定出平面的方程，有了平面的方程可以求解二面角。
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2楼2013-08-21 09:09:10
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wally8962

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
vmd中有measure dihed函数
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3楼2013-08-22 07:29:18
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)
dihed表示的是一个分子中的原子见二面角，中间是有键连接的，我需要计算两个分子间的扭转角
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自古明王圣帝，犹须勤学，况凡庶乎！
4楼2013-08-23 09:28:32
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