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768805354

新虫 (初入文坛)

[求助] 能量分解

我最近做了一些关于锂键的研究:
我们知道弱键之间的作用力主要是有静电作用,电荷转移等引起的为了进一步研究弱键的本质。我想做一下能量分解。我也听了路天的这次报告,知道multiwfn是可以做此工作的,但具体过程我不是很清楚。望资深人士给予帮助。
帮忙写上注意事项。
谢谢
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sobereva

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2013-08-20 20:25:24
Multiwfn只能做最简单的能量分解,也就是把相互作用能分解为“极化能”和“静电+交换互斥能”,见手册4.100.3的例子。

常用、经典的两类能量分解是SAPT能量分解和Morokuma能量分解。目前来说更推荐DFT-SAPT或LMOEDA能量分解,都能将总相互作用能以不同方式细分,前者专门适合高精度计算和分解弱相互作用,后者速度更快更为普适(GAMESS-US支持)。
另外还有Mayer能量分解,见《Mayer能量分解及APEX4程序使用简介》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/2358dc8bd8e9a5c8b07154de),但对于弱相互作用研究的可靠性不是很有保证。NBO5挂着GAMESS-US等程序也能做自然能量分解,但并不普及。

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2楼2013-08-20 19:07:19
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768805354

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-20 19:07:19
Multiwfn只能做最简单的能量分解,也就是把相互作用能分解为“极化能”和“静电+交换互斥能”,见手册4.100.3的例子。

常用、经典的两类能量分解是SAPT能量分解和Morokuma能量分解。目前来说更推荐DFT-SAPT或LMO ...

Multiwfn的能量分解对于弱键的相互作用可靠吗?
方法有要求吗
3楼2013-08-20 21:54:31
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sobereva

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【答案】应助回帖

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zhou2009: 金币+3 2013-08-21 09:29:35
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3楼: Originally posted by 768805354 at 2013-08-20 21:54:31
Multiwfn的能量分解对于弱键的相互作用可靠吗?
方法有要求吗...

关键看你想把弱相互作用分解成哪些能量项。反正Multiwfn只能分解成前面提到的那两部分,顶多再把色散项额外算出来(比如用传统泛函做计算,然后把DFT-D3的校正能当做色散能。或者把后HF作用能减去HF作用能当做色散能)。如果不合要求,就只能用其它的更专门的做能量分解的程序。
用于任何体系都可以。
4楼2013-08-21 09:14:01
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768805354

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-21 09:14:01
关键看你想把弱相互作用分解成哪些能量项。反正Multiwfn只能分解成前面提到的那两部分,顶多再把色散项额外算出来(比如用传统泛函做计算,然后把DFT-D3的校正能当做色散能。或者把后HF作用能减去HF作用能当做色散 ...

我启动Multiwfn进行能量分解时,为什么生不成New.gjf
我用的方法是b3lyp/6-31++g
计算的是杂环呋喃,噻吩与锂的复合物之间的弱相互作用
说明:两个片段的.Out文件是从复合物中的out文件中生成的gjf 文件计算得到的。是按见手册4.100.3的方法做的。
5楼2013-08-21 21:41:45
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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看看屏幕上有什么提示,是否提示已经输出了new.gjf,如果屏幕说已经生成了,就仔细在当前目录下找。
建议先从头到尾完全重复一遍4.100.3节的例子,成功之后再做你的体系。
6楼2013-08-22 01:22:57
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768805354

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-22 01:22:57
看看屏幕上有什么提示,是否提示已经输出了new.gjf,如果屏幕说已经生成了,就仔细在当前目录下找。
建议先从头到尾完全重复一遍4.100.3节的例子,成功之后再做你的体系。

我已经做过例子了
启动multiwfn后把两个片段都引入后,它直接就关闭了。
没法看什么提示,谢谢
7楼2013-08-22 08:37:37
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sobereva

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引用回帖:
7楼: Originally posted by 768805354 at 2013-08-22 08:37:37
我已经做过例子了
启动multiwfn后把两个片段都引入后,它直接就关闭了。
没法看什么提示,谢谢...

直接关闭说明输入文件有问题。可以把你的输入文件和输出文件都发到我邮箱里我看看sobereva@sina.com
8楼2013-08-22 10:35:32
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