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calebby

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[求助] Gaussian能否扫描偶极矩?

Gaussian可以扫描二面角势能面,我想知道随着二面角的变化,分子的偶极矩的变化情况。请教各位高手,Gaussian能做到吗?关键词该怎么设置呢?
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ccxcyh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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gmy1990: 金币+2 2013-08-21 16:36:18
用非标准输入做。可以的。

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2楼2013-08-20 10:56:09
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ccxcyh at 2013-08-20 10:56:09
用非标准输入做。可以的。

能否说得再仔细一点呢?关键词该怎么设置呢?我试着用polar,不过依然没有得到我想要的结果。。
3楼2013-08-20 15:39:30
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ccxcyh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by calebby at 2013-08-20 15:39:30
能否说得再仔细一点呢?关键词该怎么设置呢?我试着用polar,不过依然没有得到我想要的结果。。...

要用非标准输入。具体可以搜索sob的博客。非标准输入。

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4楼2013-08-21 12:41:27
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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zhou2009: 金币+5 2013-08-21 19:38:43
见此文《Gaussian的Link、IOp与非标准计算路径》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/8879d1d25e77672938f6f7dc

只要把L601放到每一轮循环过程当中就行了,这个模块会输出偶极矩。
5楼2013-08-21 18:52:49
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calebby

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引用回帖:
5楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-21 18:52:49
见此文《Gaussian的Link、IOp与非标准计算路径》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/8879d1d25e77672938f6f7dc)

只要把L601放到每一轮循环过程当中就行了,这个模块会输出偶极矩。

我参照您的帖子,修改了一下我的输入文件。对照着Gaussian官网上的Iop手册我也有了更深的理解了。只是我还有一个问题望老师指点:如果overlay为6,在输入文件里面这样写道:6/7=2,8=2,28=1/1,那么除了调用了6/7, 6/8, 6/28这几个之外,其他的比如6/12, 6/13等是没调用呢?还是按默认的选项调用呢?如果我只想知道关于偶极矩的信息,我能否就这样写6/18=0/1呢?
可能我的语句说得有些不专业,希望老师体谅。
6楼2013-08-21 22:23:47
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sobereva

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引用回帖:
6楼: Originally posted by calebby at 2013-08-21 22:23:47
我参照您的帖子,修改了一下我的输入文件。对照着Gaussian官网上的Iop手册我也有了更深的理解了。只是我还有一个问题望老师指点:如果overlay为6,在输入文件里面这样写道:6/7=2,8=2,28=1/1,那么除了调用了6/7, 6 ...

没写的选项就自动用默认的。
写上6//1就足够了
7楼2013-08-22 01:25:18
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calebby

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引用回帖:
7楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-22 01:25:18
没写的选项就自动用默认的。
写上6//1就足够了...

老师,按照你的指点,我得到了一个50M的.log文件,用GV打开的话,在results--scan下面并没有得到偶极矩随二面角变化的曲线。而这么大的文件在windows下用记事本打开的话电脑直接死机。请问老师我应该如何得到我要的这些偶极矩值呢?
8楼2013-08-22 09:22:15
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sobereva

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引用回帖:
8楼: Originally posted by calebby at 2013-08-22 09:22:15
老师,按照你的指点,我得到了一个50M的.log文件,用GV打开的话,在results--scan下面并没有得到偶极矩随二面角变化的曲线。而这么大的文件在windows下用记事本打开的话电脑直接死机。请问老师我应该如何得到我要的 ...

用Ultraedit来打开,比记事本快得多。
提取数据的话建议用Linux的shell下的各种命令,比如grep之类。
9楼2013-08-22 10:34:48
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calebby

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9楼: Originally posted by sobereva at 2013-08-22 10:34:48
用Ultraedit来打开,比记事本快得多。
提取数据的话建议用Linux的shell下的各种命令,比如grep之类。...

老师,按照你的指点,我用Ultraedit打开.log文件,检索dipole发现总共竟然有500多个。而实际上我扫描二面角是以步数为36,步长为5度来设置的,按理说是不会出现这么多的偶极矩值吧?请问老师是我什么地方弄错了吗?
10楼2013-08-22 20:51:10
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