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崔永霞

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何减少引物二聚体

各位高手,这几天我做的PCR,目的条带很弱,但是引物二聚体很强,各位高手有没有能有效的减少引物二聚体的方法?我试着减少了引物的用量,但引物二聚体还是很强。郁闷,求各位高手指点!
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每个人都有心底最柔软的地方,请不要触碰它,因为每个人都有自己的尊严!
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07bio

木虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-07-29 09:44:00
这位仁兄,你说的这篇文献你看懂了吗?能不能帮我解释下这是中什么样的方法?我没怎么看懂。。。麻烦了。。。...

大意是描述一种方法,可以消除引物二聚体的积累
These observations led to the hypothesis that a system could be developed whereby the accumulation of PDs in a PCR may be eliminated
具体方法是在引物的5‘端加入一段寡核苷酸序列
We demonstrate a method for the general suppression of PD formation that uses a sequence of additional nucleotides (a Tail) at the 5′ ends of amplimers.
文章太长,不可能帮你翻译,自己看吧。
另外,针对你的问题可以先用高浓度的模板做看看,不行再做退火梯度。
引物该怎么设计,这个网上一搜一大堆。
17楼2013-07-29 17:08:11
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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崔永霞(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你的更多精彩 2013-07-28 16:01:53
引物二聚体的减少主要是在设计引物 的时候解决的,设计的时候尽量避免回文结构,发夹结构等。。。
2楼2013-07-28 12:36:59
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宋虫虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你的更多精彩 2013-07-28 16:02:03
引物二聚体,多是由引物有太多的自身配对或者交叉配对引起的,同时引物和模板的比率太高也能引起引物二聚体的发生,反应体系需进一步优化。
让自己变得更强
3楼2013-07-28 14:58:50
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07bio

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你的更多精彩 2013-07-28 16:02:11
崔永霞: 金币+1, 有帮助 2013-07-28 18:25:25
给你篇文献自己看下
Brownie J, Shawcross S, Theaker J, Whitcombe D, Ferrie R, Newton C, Little S. The elimination of primer-dimer accumulation in PCR. Nucleic Acids Res 1997; 25:3235-3241
4楼2013-07-28 15:16:27
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