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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] ITS 构建克隆文库

小弟最近遇见一件怪事。。。
从某种样品中使用its1f 和its4r 扩增到 its 序列后 ,拟构建文库,PCR产物割胶的时候条带正常,亮度不弱。没有什么异常现象。但是克隆后在平板上长相也正常 , 做PCR 验证的时候却阳性率很低 ,四个样品分别挑八个 也就只有四个是阳性的。。。

按理说这个很简单 ,试过好几次了 都这样。烦死了块。。。

ITS 序列 在大肠杆菌质粒中表达 应该不存在什么问题吧 ,也有阳性存在,说明不是检验PCR的问题。。

这么简单一个事情 拖了一个月了 擦  。 都觉得被人质疑能力了。,。

请有经验的 帮忙指点一二。。


感受态细胞 用的是bl21 ,原来一直用DH5a 的 最近一段没了,就是有个师妹做表达 的感受态 借来用 不知道是不是这个原因。 但是 其他的样品一切正常啊  难道是这组样品的问题?
在核酸水平上序列差异应该不是问题吧? 抑郁了都。

[ Last edited by 老夏853 on 2013-7-19 at 14:04 ]
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jyc01851

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励新虫应助交流! 2013-08-06 18:06:17
感受态细胞 用的是bl21 ,原来一直用DH5a 的 最近一段没了,就是有个师妹做表达 的感受态 借来用 不知道是不是这个原因。 但是 其他的样品一切正常啊  难道是这组样品的问题?
2楼2013-08-06 14:02:37
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肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你是把its产物连在T载体上吗?然后用IPTG+X-gal的蓝白斑平板应该可以排除一些假阳性吧。
3楼2013-08-06 18:41:46
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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 肥猫p at 2013-08-06 18:41:46
你是把its产物连在T载体上吗?然后用IPTG+X-gal的蓝白斑平板应该可以排除一些假阳性吧。

没错,不过通常做克隆的时候是不用这个的,太麻烦。我后来试过,全白色,挑了依然是扩不

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2013-08-06 21:40:09
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