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echochen1017

新虫 (初入文坛)


[交流] 质粒上定点突变不用DpnI酶消化的后果

本人在已构建成功的重组质粒上定点突变,但没有使用消化酶,直接转化,有转化子,提质粒,测序,却发现在设计好的位点没有发生突变,想交流一下,是否跟消化酶有关,想知道整个详细的PCR过程和转化后在质粒模板和PCR产物在宿主菌中复制克隆的效率。谢谢啦~~~
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imsmiler

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by yunlongma at 2013-10-04 11:12:48
请问,以构建好的质粒为模板,用quikchange法进行定点突变,为什么是线性扩增而不是指数扩增,我还是没有想明白……
是因为pcr产物含有staggered nick,而不能作为模板吗?

还有得到的pcr产物是环状而且带有sr ...

模板只能是最初的质粒,后来扩增出来的有nick的不能作为模板吧。普通PCR,模板是越来越多的。这种突变法pcr模板数量是不变的,所以是线性扩增。
15楼2014-08-09 16:15:34
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
echochen1017: 金币+1 2013-07-17 11:46:26
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你的更多精彩 2013-07-17 11:53:59
DpnI酶是要消化掉模板质粒。如果没有做消化直接转化,当然有可能没有突变啦。质粒的转化效率非常高,如果没有消化掉模板,你得到的克隆基本上应该都是原质粒。
2楼2013-07-17 09:48:30
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huanghznd

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用DpnIi消化是一方面,但如果转大肠杆菌DMT的话,是否消化关系不大。一般正确率在99%以上。
3楼2013-07-17 10:06:55
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echochen1017

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
3楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-17 10:06:55
用DpnIi消化是一方面,但如果转大肠杆菌DMT的话,是否消化关系不大。一般正确率在99%以上。

转的是DH5α,最后的质粒里突变的产物能占多少呢?
4楼2013-07-17 10:12:17
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