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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 飞利白 at 2014-09-22 17:14:47
我试了一下,但是一会就没有反应了,如果正确的话是不是会提示保存在哪之类的呢。谢谢...

data文件已经产生了。在你的VMD安装路径下面
有志者,事竟成。
11楼2014-09-22 21:11:04
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飞利白

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-09-22 21:11:04
data文件已经产生了。在你的VMD安装路径下面...

我找到了,可是里面只有坐标和成键信息,没有二面角其它的,这样是不是说明初始构型有问题呀,我的初始构型是用MS里Amorphous Cell模块建的。谢谢
12楼2014-09-23 09:09:17
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

引用回帖:
12楼: Originally posted by 飞利白 at 2014-09-23 09:09:17
我找到了,可是里面只有坐标和成键信息,没有二面角其它的,这样是不是说明初始构型有问题呀,我的初始构型是用MS里Amorphous Cell模块建的。谢谢...

这跟你用这个命令的时候加的参数有关系,此参数跟你Lammps中命令atom_type的参数相同
有志者,事竟成。
13楼2014-09-23 10:06:59
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丽媛媛媛

银虫 (初入文坛)

你好,请问我用msi2lmp时总是出现cannot open frc.cvff 的情况,请问怎么解决?
14楼2015-03-02 15:16:12
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天际之虹

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 飞利白 at 2014-09-22 10:43:34
你好我现在也是用MS导入lammps生成data文件,请问用VMD该如何做啊,因为我的模型是聚合物很复杂,不能手动造data,只能借助软件。能否详细告知,谢谢了...

你好,请问你后来是如何处理VMD导出的data文件无angle,dihedral等信息的?
该觉醒了!
15楼2015-05-14 08:56:10
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飞利白

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
15楼: Originally posted by 天际之虹 at 2015-05-14 08:56:10
你好,请问你后来是如何处理VMD导出的data文件无angle,dihedral等信息的?...

我没有用VMD的,导出的键角信息根本不全,至于那个VMD导出命令建议你上网搜下吧,我不是很记得也不一定正确。
16楼2015-05-15 08:34:30
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天际之虹

木虫 (小有名气)

引用回帖:
16楼: Originally posted by 飞利白 at 2015-05-15 08:34:30
我没有用VMD的,导出的键角信息根本不全,至于那个VMD导出命令建议你上网搜下吧,我不是很记得也不一定正确。...

那你是用什么软件生成键角信息齐全的data文件呢?
该觉醒了!
17楼2015-05-18 14:56:51
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zxc252487892

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-09-22 11:05:25
vmd命令: topo writelammpsdata 文件名...

你好 用用了你的方法很方便!
但是只有0 angles 0 dihedrals 0 impropers,是我的模型有问题?
18楼2015-11-06 11:30:04
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张益坤

新虫 (初入文坛)

楼主,问一下,为什么我在用msi2lmp编译car文件时候出现不能对打不开文件的问题
科研有我,我在科研
19楼2015-11-06 18:44:30
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

引用回帖:
18楼: Originally posted by zxc252487892 at 2015-11-06 11:30:04
你好 用用了你的方法很方便!
但是只有0 angles 0 dihedrals 0 impropers,是我的模型有问题?...

添加atom类型了吗?模型导入VMD有立体的模型显示吗?
可能是模型的问题
有志者,事竟成。
20楼2015-11-10 21:47:32
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