24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 906  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fhj1027

木虫 (正式写手)

I love wei

[求助] 水中溶菌酶例题,能量最小化时出现fatal error

在做水中的溶菌酶例题(Lysozyme in Water)时,在溶剂中加入CL离子平衡电荷后进行能量最小化(EM)。

指令:grompp -f minim.mdp -c 1AKI_solv_ions.gro -p topol.top -o em.tpr

运行时出现错误:
Program grompp, VERSION 4.5.1
Source code file: string2.c, line: 105

Fatal error:
An input file contains a line longer than 4095 characters, while the buffer passed to fgets2 has size 4095. The line starts with: '20s'
完全按照例题做的,前面都没有出现错误。唯独到这一步出错。
一直没能找到解决办法,向坛子里的大侠们求助。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhj1027

木虫 (正式写手)

I love wei

★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励自己解决问题后,贴出原因供后人参考 2013-07-18 15:10:55
我已找到问题的原因。
我的输入文件不知为什么变成了Dos/Windows格式,而我这儿的集群对文件格式非常敏感。
当我把文件格式改为Unix时,则可以运行。
究其原因是Dos和unix格式文件在回车和换行时机制不一样。
3楼2013-07-18 15:05:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fhj1027: 金币+10, 有帮助, 谢谢您的回复 2013-07-18 15:03:28
你给的输入文件有问题,单行文字长度超过4k了,检查一下’20s‘开头的那一行,是不是文件格式问题,
2楼2013-07-14 15:04:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料化工调剂 总分330 +14 zhubinhao 2026-03-27 14/700 2026-03-29 10:01 by Sjndkwm
[考研] 298求调剂 +4 种圣赐 2026-03-28 4/200 2026-03-29 08:42 by q1092522407
[考研] 本科双非材料,跨考一志愿华电085801电气,283求调剂,任何专业都可以 +6 芝士雪baoo 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:16 by 松花缸1201
[考研] 332求调剂 +4 @MZB382400 2026-03-28 4/200 2026-03-28 21:02 by 唐沐儿
[考研] 085600,材料与化工321分求调剂 +9 大馋小子 2026-03-28 9/450 2026-03-28 14:56 by 神马都不懂
[考研] 求化学调剂 +4 wulanna 2026-03-28 4/200 2026-03-28 13:37 by 唐沐儿
[考研] 材料277求调剂 +7 min3 2026-03-24 7/350 2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 291求调剂 +15 hhhhxn.. 2026-03-23 21/1050 2026-03-28 11:26 by self2008
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 0856,材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 材料292调剂 +12 橘颂思美人 2026-03-23 12/600 2026-03-27 15:44 by caszguilin
[考研] 314求调剂 +3 溪云珂 2026-03-26 3/150 2026-03-27 11:20 by sanrepian
[考研] 一志愿郑大085600,310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 化学工程085602 305分求调剂 +17 RichLi_ 2026-03-25 17/850 2026-03-26 19:44 by plmuchong
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
信息提示
请填处理意见