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Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs粗粒化力场（自己写）

各位师兄师姐~
本人准大四学弟一名，正在跟着师兄做粗粒化的模拟，用的是Gromacs 4.6.2。
想要用粗粒化模拟的办法来实现DNA和双层膜的一个共同的体系，现在想的是用两个不同的力场来模拟膜和DNA，但是现在的版本下，这些力场都没有，所以我想自己写一个，但是对自己写力场这个完全不了解（我只是用Gromacs做了两个例子类型的全原子模拟而已），不知道大家能不能给个建议，比如说怎么写力场，有啥模板之类的么？谢谢了！！
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God‘s in his heaven，all's right with the world。
1楼2013-07-12 17:34:39
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xxj9618

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-07-14 20:13:50
你做的体系很常见吧  不可能要自己写
MARTINI力场在这里下就行了http://md.chem.rug.nl/cgmartini/

你好，我想问下，这个下下来怎么用阿，谢谢哦
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我有我世界。。。
9楼2014-06-23 14:35:58
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xxj9618

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Leliel at 2013-07-15 15:13:25
martini的力场我是有的，在这个网站上找到了，但是DNA的话不能用这个力场啊，我是想模拟膜和DNA的作用，所以这是2个力场的杂交，不知道你能明白么.......

请问这个martini下下来之后该如何使用。谢谢阿
赞一下 回复此楼
我有我世界。。。
10楼2014-06-23 14:36:30
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