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1988潇湘

新虫 (初入文坛)

[求助] 最近RNA提取出现问题,求助各位

一直用一个试剂盒提RNA,最近出现一种奇怪现象
先附上操作步骤
(1)在液氮中将样品研磨成粉末,研磨后立刻将样品转移到Rnase-free离心管中。
(2)加入0.5ml预冷的pBIOZOL到0.1g样品粉末中,振荡混匀5min。室温放置5分钟(将离心管横置使接触面积最大),12000 rpm,室温离心2分钟。
(3)将上清转移到新的Rnase-free离心管中,加入0.1ml 5MNacl,轻弹离心管(或用漩涡振荡)混匀。加入0.3ml氯仿,振荡混匀5min,静置分层,12000rpm,4℃离心10分钟。
(4)将上层水相转移到新的Rnase-free离心管中。加入等体积异丙醇,混匀后室温放置10分钟。12000 rpm,4℃离心10分钟。
(5)弃去上清,加1ml 75%乙醇溶液洗涤沉淀,吹打或轻弹使沉淀悬浮,12000 rpm,室温离心1分钟。
(6)弃去液体,短暂离心后,用移液器吸干残余液体,风干沉淀5min。
(7)加10-30Rnase-free水溶解RNA,保存于-80℃。
问题出现在最后沉淀的时候,平时用乙醇沉淀没有问题的,2.5体积,这两次发现用乙醇沉淀后,溶液变成乳浊液的样子,然后沉淀30min后离心,上层水相,中层沉淀层,底下居然出现大概20ul的不明液体物质,水溶性,非氯仿,只好溶解掉再抽提一次,然后就可以了,关键问题是,这个到底是什么原因啊?底下那层液体是什么东东啊?求大虾给解释下
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金虫 (小有名气)


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 应助指数-1, 鼓励发帖积极交流,分子生物期待你更多精彩。如果 非应助的话请点击不应助按钮谢谢 2013-07-10 20:38:03
顶起,最近我也要做,希望知道的高手给指点啊,谢谢
2楼2013-07-10 18:27:46
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金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主,我刚开始准备做,不懂啊,别笑啊,弱问一下下啊,是不是异丙醇呢?
3楼2013-07-10 21:20:38
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
1988潇湘: 金币+5 2013-07-13 14:29:24
1 楼主的步骤里写着用异丙醇沉淀,后面说加乙醇沉淀有问题,虽然两者都可以沉淀核酸,但你到底是用什么沉淀的呢?
2 建议严格按照试剂盒再做一遍,要检测自己的试剂有无加错,有无污染,环境各方面是否良好,出现的总会有原因,或者你问问买家,有无这种情况出现。
3 你沉淀的含RNA溶液里,肯定还含有其他物质,比如盐、未除尽的蛋白或其他试剂残留,假如这样的话,你加乙醇或异丙醇就很有可能很快出现乳状物,而且很明显的
4 至于你说底下不明液体,溶解后没事,那么不影响你的RNA质量,就说明没有影响,另外你确定它分成3层?有无可能是气泡?如果你再做一遍,还是这样,你拍个图上来给大家分析下?

以上看能否帮上忙,祝好!
思路决定出路。。。
4楼2013-07-10 22:20:52
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1988潇湘

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lmcyjxs at 2013-07-10 22:20:52
1 楼主的步骤里写着用异丙醇沉淀,后面说加乙醇沉淀有问题,虽然两者都可以沉淀核酸,但你到底是用什么沉淀的呢?
2 建议严格按照试剂盒再做一遍,要检测自己的试剂有无加错,有无污染,环境各方面是否良好,出现的 ...

之前一直是用乙醇沉的,木有什么问题的,就这两次出现了这种现象,气泡是肯定不会的,12000离心,肯定不是气泡的,直接加75%乙醇洗涤沉淀的时候,可以明显看出那些液体不溶于乙醇的,像是小油滴的样子,但是沉在底部的,如果是重新溶解后用氯仿抽提,离心后会在界面上有一层蛋白层,但不像通常的蛋白层一样很紧实的样子,是很泡泡的样子,有点像提质粒的时候那种菌体碎片的样子,有液体在里面。
这次用异丙醇沉淀就没有这种现象了,但我还是想知道那些液体是什么。
5楼2013-07-12 09:26:47
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jeffhousq

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 1988潇湘 at 2013-07-12 09:26:47
之前一直是用乙醇沉的,木有什么问题的,就这两次出现了这种现象,气泡是肯定不会的,12000离心,肯定不是气泡的,直接加75%乙醇洗涤沉淀的时候,可以明显看出那些液体不溶于乙醇的,像是小油滴的样子,但是沉在底 ...

LZ关于之前出现的那种小油滴的东西,后来解决了吗?我之前很长一段时间都提的还算不错,最近提取总是出现问题,也是出现了这种小油滴状的东西,不知道是什么原因,请问你后来怎么解决的啊?不胜感谢!
6楼2016-03-21 07:32:42
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