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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] (已解决)DNA片段小于200bp,NCBI 提交通不过怎么办? 已有3人参与

DGGE胶条带回收后克隆测序,测序公司返回的片段大小小于200。 想NCBI 中genebank 提交后,返回的意见是:片段小于200, 不予接受 。我该怎么办呢?
或者有没有别的数据库可以提交的?
写文章总要是没有序列号的话,杂志社会同意发表吗?


请知情者告知,谢谢!

[ Last edited by fzhrobin on 2013-7-22 at 15:56 ]
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

谢谢楼上的。
其实我主要也是要看下有哪些微生物组成,想把其中的某些有特殊功能的片段和比对出来的序列做个系统树,觉得这样写文章有图更形象些。也希望这样能够和我最初做DGGE的目的吻合起来,自圆其说。
3楼2013-07-10 10:09:29
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liujianmin68

木虫 (职业作家)

努力发展交叉学科

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1949stone: 学习下 2013-07-10 08:27:09
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-12 01:54:21
NCBI数据库中有核酸、蛋白、基因组、EST等库,像你的片段比较小,做DGGE其实就是看不同处理情况下特异性条带或者环境中微生物群落特征,如果你是分析微生物组成,比对看有哪些微生物就可以了,没必要提交序列吧,如果是其它的,是不是在EST数据库提交可以呢?你试试吧,希望你能成功。
转向地质微生物学
2楼2013-07-10 08:22:48
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wangzhongyu

铁虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+1, 鼓励新虫交流 2013-07-11 14:44:55
可以发表的,但要把序列发在你要发的文章里面!
4楼2013-07-11 14:19:15
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

已经成功提交到NCBI.
在描述里面写清楚序列来自DGGE就可以了。
5楼2013-07-22 15:55:58
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