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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » （已解决）DNA片段小于200bp，NCBI 提交通不过怎么办？
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] （已解决）DNA片段小于200bp，NCBI 提交通不过怎么办？ 已有3人参与

DGGE胶条带回收后克隆测序，测序公司返回的片段大小小于200。 想NCBI 中genebank 提交后，返回的意见是：片段小于200， 不予接受 。我该怎么办呢？
或者有没有别的数据库可以提交的？
写文章总要是没有序列号的话，杂志社会同意发表吗？


请知情者告知，谢谢！

[ Last edited by fzhrobin on 2013-7-22 at 15:56 ]
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1楼 2013-07-09 15:53:11
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liujianmin68

木虫 (职业作家)

努力发展交叉学科
★ ★ ★
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1949stone: 学习下 2013-07-10 08:27:09
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-07-12 01:54:21
NCBI数据库中有核酸、蛋白、基因组、EST等库，像你的片段比较小，做DGGE其实就是看不同处理情况下特异性条带或者环境中微生物群落特征，如果你是分析微生物组成，比对看有哪些微生物就可以了，没必要提交序列吧，如果是其它的，是不是在EST数据库提交可以呢？你试试吧，希望你能成功。
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转向地质微生物学
2楼2013-07-10 08:22:48
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
谢谢楼上的。
其实我主要也是要看下有哪些微生物组成，想把其中的某些有特殊功能的片段和比对出来的序列做个系统树，觉得这样写文章有图更形象些。也希望这样能够和我最初做DGGE的目的吻合起来，自圆其说。
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3楼2013-07-10 10:09:29
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wangzhongyu

铁虫 (小有名气)
★ ★
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kx444555: 金币+1, 鼓励新虫交流 2013-07-11 14:44:55
可以发表的，但要把序列发在你要发的文章里面！
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4楼2013-07-11 14:19:15
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
已经成功提交到NCBI.
在描述里面写清楚序列来自DGGE就可以了。
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5楼2013-07-22 15:55:58
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zq347597638

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好 我想问下你的PCR体系是什么，我做的V3
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6楼2013-08-08 10:39:52
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