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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 真菌被超级细菌污染咋办
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christll

新虫 (初入文坛)

[交流] 真菌被超级细菌污染咋办 已有8人参与

大神们，我的丝状真菌被一种超级细菌污染了，导致提取的DNA无法进行全基因组测序。这种细菌抗多种抗生素，真菌也无法划线培养。培养过程中也完全看不出有细菌污染的状况，但是一16S 检测就出问题了。该如何是好啊？
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1楼 2013-07-04 23:46:56
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

l68266152

银虫 (小有名气)
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真菌不应该是做18s么？16s做出来的会不会是核糖体的？不能用涂平板，如果真是染菌，要用稀释倒平板。
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相信自己
5楼2013-07-05 09:07:46
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javadig

至尊木虫 (著名写手)
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污染的是那种红色菌落的细菌吗？
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2楼2013-07-05 06:09:43
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zhaodahe

木虫 (正式写手)
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显微镜下都看不到吗？你用抗生素就是很强烈的杀死或抑制细菌，如果超级细菌，可以尝试别的方式减慢细菌的生长，然后通过在平板上挑取很少的菌苔逐步纯化。比如在极端ph或盐度下，细菌可能会很受影响，真菌应该有一定耐受。我还怀疑，有没有可能是感染了内生细菌，所以才抗很多抗生素？我不懂，只是瞎猜。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2013-07-05 08:01:02
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snqguang

新虫 (小有名气)
★
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真菌无法划线培养？那你的真菌从哪里面接过来的？做个梯度稀释涂个平板看看。
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4楼2013-07-05 08:04:59
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christll

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by l68266152 at 2013-07-05 09:07:46
真菌不应该是做18s么？16s做出来的会不会是核糖体的？不能用涂平板，如果真是染菌，要用稀释倒平板。

DNA测序需要有个16S检测,看是否有细菌的污染.
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6楼2013-07-05 17:35:20
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christll

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by snqguang at 2013-07-05 08:04:59
真菌无法划线培养？那你的真菌从哪里面接过来的？做个梯度稀释涂个平板看看。

呈蓬松的丝状,菌丝很长.不好做划线
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7楼2013-07-05 17:36:29
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christll

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhaodahe at 2013-07-05 08:01:02
显微镜下都看不到吗？你用抗生素就是很强烈的杀死或抑制细菌，如果超级细菌，可以尝试别的方式减慢细菌的生长，然后通过在平板上挑取很少的菌苔逐步纯化。比如在极端ph或盐度下，细菌可能会很受影响，真菌应该有一定 ...

您说的内生菌   也有人提到过,不过不懂这方面,有什么办法可以检测是否是内生菌的吗? 谢谢
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8楼2013-07-05 17:37:50
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fenghan06

银虫 (小有名气)
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Effect of agar concentration on the matric potential of glycerol agar media and the germination and growth of xerophilic and non-xerophilic fungi.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19520449

这是当时我参与的项目发的文章， 关于交叉食物干燥条件以及防腐剂来达到抑制微生物生长， 具体细节我忘记了
这个做的是抑制真菌。

但是做的那个培养基压根就不怕细菌感染， 培养基都在开放条件下倒的， 没细菌能在上面长
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14楼2013-07-06 09:59:46
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普通回帖

zhaodahe

木虫 (正式写手)
★
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我也??懂，???是觉得有这?????能，但其实???能性挺??。你??稀释涂???，看能???拿到纯培养，???能更实用一些。

[ ????????? http://muchong.com/3g ]
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9楼2013-07-05 17:50:31
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zhaodahe

木虫 (正式写手)
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???????:
8?: Originally posted by christll at 2013-07-05 17:37:50
???????????   ?????????,????????????,???????????????????????????? лл...

我也??懂，???是觉得有这?????能，但其实???能性挺??。你??稀释涂5???，看能???拿到纯培养，???能更实用一些。

[ ????????? http://muchong.com/3g ]
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10楼2013-07-05 17:53:15
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