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xulanzzz

金虫 (著名写手)

[求助] 如何将DNA序列和pro序列做成如下图所示的格式

求助:
如何将DNA序列和pro序列做成如下图所示的格式(某专利中的序列文件):
1 上一行为DNA 对应下行为氨基酸序列
2 氨基酸序列下面有对应的氨基酸对应的number
请问各位高手,有没有软件可以直接生成这种格式的序列文件?如何将DNA序列和pro序列做成如下图所示的格式
[muchong.com][730915]图.jpg
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  • 2013-07-03 08:28:28, 84.02 K

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DOBEST
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niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-04 03:02:50
xulanzzz: 金币+5, 有帮助, 谢谢 我试一下 2013-07-04 08:50:35
http://pan.baidu.com/share/link? ... p;amp;uk=2735555140
试试 这个小程序吧。
要求用记事本存储编码区序列,只有ATGC,无其他字符出现 ,无移码,阅读框为+1. 用英文或者数字命名文件。
将要处理的序列文件 和这个小程序放到同一个目录中,双击程序,按照提示进行。然后在该目录下生成一个结果文件。
Stop fighting,let it flow.
4楼2013-07-03 21:30:43
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1949stone

荣誉版主 (知名作家)

海纳百川

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xulanzzz: 金币+1, DNAman DNAstar 2013-07-03 10:47:21
xulanzzz: 金币+1, 有帮助, 请给出详细说明,DNAman和DNAstar我们经常使用,但是目前还不能生成上面这种格式的文件。 2013-07-03 10:50:00
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-04 03:02:35
mega,DNAman,或者上网上直接在网上搜索一下(序列翻译),这种软件很多的。输出格式你也可以选择的。
海纳百川止于至善
2楼2013-07-03 08:45:51
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xulanzzz

金虫 (著名写手)

patentin是一种专门处理专利中序列信息的软件,可以实现这种序列格式。所有专利中的序列文件需要PATENTIN进行处理。
DOBEST
5楼2013-07-05 12:36:56
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