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rorob

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 均方回转半径与根均方回转半径两者的定义及区别，如何计算

想通过分子模拟方法计算高分子链的均方回转半径
set atomss [atomselect top "resname FMA1 MMA2 MMA3 and z<0"]
set indexss [$atomss list]
set masscenterss [measure center $atomss]
foreach i $indexss {
lappend atomcenters [measure center [atomselect top "index $i"]]
}
#puts $atomcenters
foreach cccc $atomcenters {
#lappend rg0 [veclength2 [vecsub $masscenterss $cccc]]
lappend rg0 [expr [veclength2 [vecsub $cccc $masscenterss]]**2]
}
#puts $rg0
set lengthss [llength $rg0]
set amount 0
for {set numm 0} {$numm < $lengthss} {incr numm} {
set amount [expr [lindex $rg0 $numm]+$amount]
}
puts [ $amount/$lengthss]
unset rg0 atomcenters numm amount

这是我未整理过的测试脚本
大概的意思就是：计算高分子链每个原子的质心到整个链段质心间的距离的平方，然后加和除以原子数。得到一个平均值。我不知道这样计算对不对，还有没有可供参考的数量做比较。

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O‘Reilly&Associates

1楼2013-07-02 10:34:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

sciencejoy

新虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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引用回帖:

4楼: Originally posted by rorob at 2013-07-02 16:26:38
书上一般说的都是理想链，对应每个粒子的质量都是相等的，而我做的体系，粒子的质量是不同的，我不知道有没人专门统计过某种聚合物某个聚合度在一定温度，溶剂或熔体中的均方回转半径的数值，还有这个值的单位是什 ...

均方回转半径是长度的量纲，单位可以方便选取，纳米或者用其他长度约化。你这个选题好怪异，研究这个问题意义在哪里？