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rorob铜虫 (初入文坛)
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均方回转半径与根均方回转半径两者的定义及区别，如何计算
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想通过分子模拟方法计算高分子链的均方回转半径 set atomss [atomselect top "resname FMA1 MMA2 MMA3 and z<0"] set indexss [$atomss list] set masscenterss [measure center $atomss] foreach i $indexss { lappend atomcenters [measure center [atomselect top "index $i"]] } #puts $atomcenters foreach cccc $atomcenters { #lappend rg0 [veclength2 [vecsub $masscenterss $cccc]] lappend rg0 [expr [veclength2 [vecsub $cccc $masscenterss]]**2] } #puts $rg0 set lengthss [llength $rg0] set amount 0 for {set numm 0} {$numm < $lengthss} {incr numm} { set amount [expr [lindex $rg0 $numm]+$amount] } puts [ $amount/$lengthss] unset rg0 atomcenters numm amount 这是我未整理过的测试脚本 大概的意思 就是 ：计算高分子链每个原子的质心到整个链段质心间的距离的平方，然后加和除以原子数。得到一个平均值。我不知道这样计算对不对，还有没有可供参考的数量做比较。 |
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