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求助：关于内坐标优化结构时，梯度转化的问题
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目前，我所研究的内容是：使用内坐标进行结构的优化。 已知：笛卡尔坐标系下的坐标(x,y,z)以及力(Fx,Fy,Fz) 如果使用内坐标优化的话，首先需要将笛卡尔坐标系下的坐标(x,y,z)以及力(Fx,Fy,Fz) 转化成内坐标的形式, 目前，坐标已经转化完毕了，但是相对应的力，不知道应该如何转化？？ 下面以甲烷为例，进一步说一下我的问题所在: 已知：CH4的笛卡尔坐标以及力 Cartesian coordinates: --------------------------------------------------------------------- Center Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number X Y Z --------------------------------------------------------------------- 1 6 0.000000 0.000000 0.000000 2 1 0.625276 0.625276 0.625276 3 1 -0.625276 -0.625276 0.625276 4 1 -0.625276 0.625276 -0.625276 5 1 0.625276 -0.625276 -0.625276 --------------------------------------------------------------------- Force:: ------------------------------------------------------------------------------------------ Center Atomic Forces (Hartrees/Bohr) Number Number X Y Z ------------------------------------------------------------------------------------------- 1 6 0.000000000 0.000000000 0.000000000 2 1 0.000000000 0.000000000 0.000000425 3 1 0.000000401 0.000000000 -0.000000142 4 1 -0.000000200 -0.000000347 -0.000000142 5 1 -0.000000200 0.000000347 -0.000000142 ------------------------------------------------------------------- 我使用tinker中的一个子程序可以将笛卡尔坐标转化成内坐标 internal coordinates: ------------------------------------------------------------------- bond angle tors ------------------------------------------------------------------- 1 2 1 1.08300 3 1 1.08300 2 109.4712 4 1 1.08300 2 109.4712 3 120.0000 5 1 1.08300 2 109.4712 3 -120.0000 ------------------------------------------------------------------- 下面，我就不知道如何将力，也就是负的梯度，也传化成内坐标的形式呢？？ [ 来自小组 减肥吧 ] |
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