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B612

铁虫 (小有名气)

[求助] 过渡态 输入

这两个输入文件都说是电荷和多重度出错,哪位高人帮忙指正一下
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把输入文件贴出来让我看一下~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

思想有多远,我们就能走多远~
2楼2013-06-13 09:18:42
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B612

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-06-13 09:18:42
把输入文件贴出来让我看一下~

#p hf/3-21g opt=qst2 test

Gaussian Test Job 302:
reactant NH3 +H2O -> NH4+ + OH- ts with constrained transition vector

0 1
N                 -1.38045000    0.02158200    0.00126100
H                 -1.88834800    0.79233600   -0.43213000
H                 -1.77110400   -0.09285000    0.93643400
H                 -1.63312200   -0.81846200   -0.51955600
O                  1.55348700   -0.10710600   -0.00042500
H                  1.94052700    0.77621000    0.00422200
H                  0.58730200    0.04853600    0.00559900


product NH3 +H2O -> NH4+ + OH- ts with constrained transition vector

0 1
N(Fragment=2)      0.08607170   -0.00764641   -0.00002168
H(Fragment=2)     -0.12298652   -0.87570741   -0.49753697
H(Fragment=2)      0.73605805   -0.20126455    0.76468565
H(Fragment=2)      0.50957914    0.66161851   -0.64590146
O(Fragment=1)     -2.01218101    0.85544299    1.16028086
H(Fragment=1)     -2.94967356    0.69223053    0.92603863
H(Fragment=2)     -0.77832237    0.38459985    0.37867446
3楼2013-06-13 15:23:58
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B612

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-06-13 09:18:42
把输入文件贴出来让我看一下~

#p hf/3-21g opt=qst2 test

Gaussian Test Job 302:
reactant NH3 +H2O -> NH4+ + OH- ts with constrained transition vector

0 1
N                 -1.38045000    0.02158200    0.00126100
H                 -1.88834800    0.79233600   -0.43213000
H                 -1.77110400   -0.09285000    0.93643400
H                 -1.63312200   -0.81846200   -0.51955600
O                  1.55348700   -0.10710600   -0.00042500
H                  1.94052700    0.77621000    0.00422200
H                  0.58730200    0.04853600    0.00559900


product NH3 +H2O -> NH4+ + OH- ts with constrained transition vector

0 1 -1 2 1 2
N(Fragment=2)      0.08607170   -0.00764641   -0.00002168
H(Fragment=2)     -0.12298652   -0.87570741   -0.49753697
H(Fragment=2)      0.73605805   -0.20126455    0.76468565
H(Fragment=2)      0.50957914    0.66161851   -0.64590146
O(Fragment=1)     -2.01218101    0.85544299    1.16028086
H(Fragment=1)     -2.94967356    0.69223053    0.92603863
H(Fragment=2)     -0.77832237    0.38459985    0.37867446
4楼2013-06-13 15:24:29
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B612

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by marson at 2013-06-13 09:18:42
把输入文件贴出来让我看一下~

关键就在于产物的电荷和自旋多重度不知道为什么分开设置,和放一块设置都不对。谢谢你能帮我
5楼2013-06-13 15:25:58
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-06-15 06:35:12
你尝试过根据反应物和产物的构型来猜想TS的构型没有,你猜想一个TS构型后直接进行TS的优化?
这种方法来寻找TS我没有做过,对这种输入方式不是很熟悉~
我觉得可以直接猜想一个TS,整个的体系带的电荷代表电荷数,自选多重度看有几个单电子轨道即可~
思想有多远,我们就能走多远~
6楼2013-06-14 08:37:00
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by B612 at 2013-06-13 15:25:58
关键就在于产物的电荷和自旋多重度不知道为什么分开设置,和放一块设置都不对。谢谢你能帮我...

是格式设置的规定,所以分开设置。目测你的输入文件有点问题:
1.反应物坐标下面貌似空了两行,空一行即可
2.产物的电荷和自旋多重度设置的有点问题
希望对你有帮助。。
潜心
7楼2013-06-14 13:13:47
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B612

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by dai_shen844 at 2013-06-14 13:13:47
是格式设置的规定,所以分开设置。目测你的输入文件有点问题:
1.反应物坐标下面貌似空了两行,空一行即可
2.产物的电荷和自旋多重度设置的有点问题
希望对你有帮助。。...

可否详细指点一下有什么问题?
8楼2013-06-14 17:45:22
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B612

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by marson at 2013-06-14 08:37:00
你尝试过根据反应物和产物的构型来猜想TS的构型没有,你猜想一个TS构型后直接进行TS的优化?
这种方法来寻找TS我没有做过,对这种输入方式不是很熟悉~
我觉得可以直接猜想一个TS,整个的体系带的电荷代表电荷数, ...

猜想了,不收敛,可能是猜的构型不合理..
9楼2013-06-14 17:46:09
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by B612 at 2013-06-14 17:46:09
猜想了,不收敛,可能是猜的构型不合理.....

可以花一部分时间在构型的调整上面,连接反应物跟产物的一般都会存在一个TS的~
思想有多远,我们就能走多远~
10楼2013-06-15 10:51:46
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