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broaddepth

木虫 (小有名气)

[求助] 请教一个arms-pcr测定snps的基础问题

请教大家,我最近要弄一个用arms-pcr方法检测snp位点的方案,但是对于基本的原理还是不太清楚,以前不是学这个的。

比如,有一个snp位点是C-T变异

目标碱基序列是这样的

------------T------------
------------A------------
如果没有出现这个snp变异的话,碱基序列是不是像下面这样的?
------------C------------
------------G------------

如果按照arms-pcr的方法去检测这个snp位点的话,是不是要2条上游引物和1条下游的公用引物?

那这2条上游引物,是不是要分别去与这两种碱基序列相同或互补?
2条上游引物的3‘端,是不是应该分别是A和G?是不是像下面这样?

      ----A     上游引物1
------------T------------
------------A------------


         ----G      上游引物2
------------C------------
------------G------------


谢谢大家

[ Last edited by broaddepth on 2013-6-7 at 23:24 ]
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