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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 如何才能得到 截角八面体的 金纳米颗粒 的模型结构

有没有软件来构建这一结构, MS好像很难做这个啊
如果编程的话,哪位高手能提供一下这方面的例子啊
谢谢!
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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
ben_ladeng: 金币+1, 鼓励交流 2013-06-06 21:58:46
vmd应该可以,你能切成任何你想要的形状。
你得清晰的知道,各个界面的数学表达式。
2楼2013-06-06 20:15:54
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lei0736

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-07 08:53:57
MS可以截切 建一个大的FCC晶体 沿着111和100方向切就是了 很简单
3楼2013-06-07 08:40:47
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voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lei0736 at 2013-06-07 08:40:47
MS可以截切 建一个大的FCC晶体 沿着111和100方向切就是了 很简单

谢谢,我以前用过MS切slab结构,可是这种cluster结构的怎么切啊,
用surface cleave 切出来只能是表面结构的, 用手工一点点切又切不好

能否详细说一下呢
4楼2013-06-08 09:17:24
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voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-06-06 20:15:54
vmd应该可以,你能切成任何你想要的形状。
你得清晰的知道,各个界面的数学表达式。

谢谢! 能否详细说一下流程呢?或者有没有相关的例子?
5楼2013-06-08 09:18:26
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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

★ ★
voleyes: 金币+2 2013-06-09 15:08:24
引用回帖:
5楼: Originally posted by voleyes at 2013-06-08 09:18:26
谢谢! 能否详细说一下流程呢?或者有没有相关的例子?...

你去NAMD 官网上看一个教程 《Modeling Nanopores for Sequencing DNA》,里面建立的碳化硅模型,cutPore.tcl 脚本就是你可以参考的例子。
6楼2013-06-08 09:30:26
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lei0736

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【答案】应助回帖

6266个原子 大概5点几个纳米
7楼2013-06-08 09:55:48
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lei0736

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+3, 酷!!!!!!!!!! 2013-06-09 14:17:15
voleyes: 金币+3 2013-06-09 15:08:34
引用回帖:
5楼: Originally posted by voleyes at 2013-06-08 09:18:26
谢谢! 能否详细说一下流程呢?或者有没有相关的例子?...

rutu
如何才能得到 截角八面体的 金纳米颗粒 的模型结构
Graph1.PNG


如何才能得到 截角八面体的 金纳米颗粒 的模型结构-1
6266.JPG

8楼2013-06-08 10:02:21
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voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lei0736 at 2013-06-08 10:02:21
rutu

Graph1.PNG

6266.JPG
...

谢谢,能否把坐标发给我啊?
9楼2013-06-09 10:59:48
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lei0736

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已发 请查收
10楼2013-06-09 12:02:54
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