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026li

金虫 (小有名气)

[求助] 寻找过渡态,IRC forward方向一直下降,reverse方向先上升后有下降

做一个甲基化反应,找的过渡态做IRC,总是forward方向下降,reverse方向先上升,后下降。
取reverse中IRC最高点,直接再做IRC-reverse,结果只能走2步,成上升趋势,用上升的最高点再做IRC还是先上升后下降.
尝试用取reverse中IRC最高点,做TS,又会回到最一开始找到的TS结构,做IRC,同一开始的reverse方向先上升,后下降情况相同。陷入死循环状态。

请教一下,可否认为,只要TS链接IRC两端产物,不管上升与否都认定是过渡态?虚频是有一个。
寻找过渡态,IRC forward方向一直下降,reverse方向先上升后有下降
上升-下降.jpg
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-06-04 18:09:17
026li: 金币+3, 有帮助 2013-06-04 19:54:05
首先你的irc出问题了,正常情况下应该是两边走的点一样多。其次图中能量低的点是因为irc出错引起的,忽略掉
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
2楼2013-06-04 14:44:28
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026li

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 独孤狼 at 2013-06-04 14:44:28
首先你的irc出问题了,正常情况下应该是两边走的点一样多。其次图中能量低的点是因为irc出错引起的,忽略掉

谢谢你的回复,forward和reverse是分开做的,上面的图是reverse的。如果不是分开做,irc总是向forward的方向走,得不到两边都有的情况。其中那个跳点,论坛里其他帖子说是高斯自己的问题。
请问:如果分开做irc的forward和reverse,能得到两端产物,只是存在reverse中找到的过渡态非irc的最高点,这个过渡态可以接受吗?
3楼2013-06-04 19:57:49
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026li

金虫 (小有名气)

请高手们指点一下啊。
4楼2013-06-06 15:01:06
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sujialing

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
026li: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-06-07 13:30:12
可以把那个最低点去掉,前提是你确定你找的过渡态是非常准确的。
越努力,越幸运!
5楼2013-06-06 15:46:53
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026li

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sujialing at 2013-06-06 15:46:53
可以把那个最低点去掉,前提是你确定你找的过渡态是非常准确的。

你的意思是,即使找的TS不是irc最高点也可以么?
6楼2013-06-07 13:30:54
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大猩猩

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 026li at 2013-06-07 13:30:54
你的意思是,即使找的TS不是irc最高点也可以么?...

应该不是吧。也许你找的TS并不对,要看看振动方向是否符合成键趋势。
7楼2013-06-09 01:11:05
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sujialing

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 026li at 2013-06-07 13:30:54
你的意思是,即使找的TS不是irc最高点也可以么?...

有这种情况,我遇到过,因为我不知道你的体系,所以我不能很确定的说你的过渡态是对的,你要综合振动分析和IRC的结果来确定过渡态。
越努力,越幸运!
8楼2013-06-13 09:53:27
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

您好,可以分享给我个你做IRC分析的例子吗。小白一枚,请不吝赐教。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8018011
9楼2014-10-15 12:10:13
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