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xiongxiong5712新虫 (小有名气)
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原子受力没有达到收敛标准计算就结束了 已有1人参与
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用siesta进行结构优化，由于是六方晶系，首先通过拟合得到了能量最低对应的体积，MD.TypeOfRun设置为CG，然后再保持这个体积不变，优化晶格参数，MD.TypeOfRun 设置为Broyden，具体的fdf文件如下： SystemName bulk SystemLabel bulk NumberOfAtoms 14 NumberOfSpecies 2 %block ChemicalSpeciesLabel 1 14 Si 2 7 N %endblock ChemicalSpeciesLabel LatticeConstant 1 Ang %block LatticeVectors 6.571864087507342 -3.794267500000001 0.000000000000000 0.000000000000000 7.588534999999999 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.906249000000000 %endblock LatticeVectors %block kgrid_Monkhorst_Pack 5 0 0 0 0 5 0 0 0 0 12 0 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack AtomicCoordinatesFormat Fractional %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.3323000000000000 0.0314000000000000 0.2500000000000000 2 -0.0314000000000000 0.3009000000000000 0.2500000000000000 2 -0.3009000000000000 -0.3323000000000000 0.2500000000000000 2 -0.3323000000000000 -0.0314000000000000 0.7500000000000000 2 0.0314000000000000 -0.3009000000000000 0.7500000000000000 2 0.3009000000000000 0.3323000000000000 0.7500000000000000 2 0.3333333333333330 0.6666666666666670 0.2500000000000000 2 -0.3333333333333330 -0.6666666666666670 0.7500000000000000 2 0.1733000000000000 -0.2306000000000000 0.2500000000000000 1 0.2306000000000000 0.4039000000000000 0.2500000000000000 1 -0.4039000000000000 -0.1733000000000000 0.2500000000000000 1 -0.1733000000000000 0.2306000000000000 0.7500000000000000 1 -0.2306000000000000 -0.4039000000000000 0.7500000000000000 1 0.4039000000000000 0.1733000000000000 0.7500000000000000 1 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies xc.functional LDA xc.authors CA MeshCutoff 100 Ry PAO.BasisSize DZP PAO.EnergyShift 75 mev MD.MaxForceTol 0.05 eV/Ang DM.MixingWeight 0.01 DM.NumberPulay 10 MaxSCFIterations 200 SolutionMethod diagon MD.TypeOfRun Broyden MD.NumCGsteps 500 MD.VariableCell .true. MD.ConstantVolume .true. MD.RelaxCellOnly .true. 优化很快， Begin CG move = 1的时候就结束了，dMax达到了收敛标准，但是原子受力没有收敛，结果是： siesta: Atomic forces (eV/Ang): ---------------------------------------- Tot -0.000014 -0.000041 -0.000144 ---------------------------------------- Max 0.722244 Res 0.314921 sqrt( Sum f_i^2 / 3N ) ---------------------------------------- Max 0.722244 constrained 可见原子受力没有达到0.05以下，而计算就正常结束了。请教大家，这是什么原因引起的啊？是不是我MD.TypeOfRun 设置为Broyden的原因呢？用这种方法优化的时候应该注意什么？有劳各位帮帮忙，多谢了。 [ Last edited by xiongxiong5712 on 2013-5-31 at 21:46 ] |
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xiongxiong5712
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自己顶一下。麻烦各位大侠百忙中帮我看看，或者提示一下也行。我先说说我的看法：是不是因为MD.TypeOfRun 不是CG，计算不会进行CGmove的循环，所以在Begin CG move = 1的时候就结束了，是否收敛也不是看force里的Max，而是有一个地方给出了每个原子的受力： siesta: Atomic forces (eV/Ang): siesta: 1 -0.368915 -0.160954 -0.000062 siesta: 2 0.323778 -0.238986 -0.000043 siesta: 3 0.045044 0.399972 0.000016 siesta: 4 0.368938 0.160918 0.000009 siesta: 5 -0.323802 0.238974 -0.000020 siesta: 6 -0.045044 -0.399962 -0.000040 siesta: 7 0.000000 -0.000020 -0.000041 siesta: 8 -0.000020 0.000009 0.000023 siesta: 9 0.450554 -0.573922 -0.000001 siesta: 10 0.271759 0.677123 0.000003 siesta: 11 -0.722307 -0.103215 -0.000009 siesta: 12 -0.450542 0.573917 0.000002 siesta: 13 -0.271775 -0.677130 0.000005 siesta: 14 0.722304 0.103217 0.000011 siesta: ---------------------------------------- siesta: Tot -0.000027 -0.000058 -0.000148 最后一行是总的受力，是不是看这个地方收敛即可？（CG方法没有给出这一结果）。不知道我猜测的对不对，请大家指正。 |
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