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marmot002

铁虫 (初入文坛)

[求助] 乙酸和羟基自由基反应

1.不考虑相态,就一个乙酸分子羧基上的H和一个羟基自由基反应,生成乙酸自由基和一个水,能否拿g09算过渡态
2.过渡态的样子大概是什么

下面是我猜测的构型,拿ts直接优化l999

# opt=(calcfc,ts) uhf/6-31+g(d)

test

0 2
C                  0.60137700   -0.00603500   -0.00008500
O                  0.28586600    1.25484800   -0.00001800
O                 -0.23004300   -0.88124800   -0.00010500
H                 -1.37416600   -0.51933200   -0.00010100
C                  2.08115000   -0.25473400    0.00006200
H                  2.32179900   -0.83632000    0.88088700
H                  2.32135200   -0.84051400   -0.87807000
H                  2.64724900    0.66605100   -0.00217400
O                 -2.41439400    0.07893600   -0.00002000
H                 -3.14283200   -0.52556500    0.00073700.
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luyang_982

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的乙酸和羟基自由基已经分别优化过了吗?先分别优化,再找过渡态。
2楼2013-05-22 11:19:34
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luyang_982

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

反应是羟基自由基上的氧夺取乙酸上的氢的过程,所以氧在两个氢之间。
3楼2013-05-22 11:23:16
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marmot002

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by luyang_982 at 2013-05-22 11:19:34
你的乙酸和羟基自由基已经分别优化过了吗?先分别优化,再找过渡态。

优化过了···
4楼2013-05-22 21:44:10
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marmot002

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luyang_982 at 2013-05-22 11:23:16
反应是羟基自由基上的氧夺取乙酸上的氢的过程,所以氧在两个氢之间。

角度怎么设定呢
5楼2013-05-22 21:44:44
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ZZU2011

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议你别初猜结构,直接qst2找过渡态,如果报错了,可以在此基础上再ts这样比你自己猜的要准确的多
6楼2013-05-23 08:45:10
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luyang_982

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by marmot002 at 2013-05-22 21:44:44
角度怎么设定呢...

角度的话需要自己调整了,查查相关文献做为参考。
7楼2013-05-23 11:14:29
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marmot002

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ZZU2011 at 2013-05-23 08:45:10
建议你别初猜结构,直接qst2找过渡态,如果报错了,可以在此基础上再ts这样比你自己猜的要准确的多

试过几个
总是l999
8楼2013-05-23 13:06:34
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