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禅猫峰

木虫 (小有名气)

[求助] 急切需要帮助!!1miRNA序列对比

我有两组miRNA的成熟序列,每组分别都有上百条,想比对这两组的miRNA之间序列相似度,一条条进行工作量太大了,请问有什么方法可以方便用来进行很快的比对?
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他山之石可以攻玉
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niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
禅猫峰(myprayer代发): 金币+1, 感谢你的慷慨解囊,期待你的精彩。 2013-05-20 08:29:09
禅猫峰: 金币+14, 有帮助 2013-05-21 10:41:37
内容已删除
Stop fighting,let it flow.
2楼2013-05-17 22:14:20
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niil

金虫 (正式写手)

进行blastn时,记得加上参数 -outfmt 6, 输出的结果可以用Excel打开,就可以排序了。
Stop fighting,let it flow.
3楼2013-05-17 22:20:28
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