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春华秋实2020

金虫 (正式写手)

[交流] MS中建立石墨烯模型导入VASP中计算 已有6人参与

最近为了在VASP中弛豫石墨烯,要在在MS中建立石墨烯模型,总结了一下步骤,仅供参考:
1、打开material studio,新建一个工程,import石墨graphite.msi,在structure/ceramic中
2、build->make p1(目的是消除对称性,这样才能够删除一层原子)。
3、删除一层原子(选中原子->delete),并移动剩下的原子到中间。
4、构建supercell(方便掺杂,也为了好看):build->symetry->supercell,构建一个6*6*1的超原胞,这样建立的超胞模型是扶手型。

要建立锯齿状的,在建立supercell之前,build>symmetry>find symmetry,然后impose symmetry,此时只显示两个原子,然后建立supercell,6*6*1

(如果需要supercell是斜六面体,这样就可以了,如果需要矩形,继续下一步)
5、修改晶格参数:build->crystal->rebuild crystal,设置方位角和length。由斜六面体改为矩形首先改方位角,如果只改方位角,会发现周期性边界变化,

所以还要修改length,修改以后变成矩形。我的是6*6*1,a:12.78,b:12.2999

6、下面就是需要导出到VASP中
点击castep计算energy,保存file,到相应文件夹下找到graphite (66-cub).cell文件,此文件为隐含文件,打开,把相应的lattice parameter和坐标拷到POSCAR,就搞定了。

[ Last edited by 春华秋实2020 on 2013-5-15 at 17:28 ]
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春华秋实2020

金虫 (正式写手)

本来还画了几张图,上传老出问题,就没有放图了。
2楼2013-05-14 14:30:05
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普通回帖

tsglss

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主纳米线怎么建?
做好自己
3楼2013-05-15 07:51:01
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wangjb401

禁虫 (著名写手)

送红花一朵
本帖内容被屏蔽

4楼2013-05-15 08:49:38
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wangjb401

禁虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

5楼2013-05-15 08:51:59
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春华秋实2020

金虫 (正式写手)

我也是刚开始学习,纳米带是不是应该去掉边界,加H啊,
6楼2013-05-15 15:15:53
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天道and酬勤

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,这样的建模是不是建立的2层的啊?怎么整成元胞?
游走在学术海洋的小鱼
7楼2013-05-16 15:49:53
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春华秋实2020

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 天道and酬勤 at 2013-05-16 15:49:53
楼主,这样的建模是不是建立的2层的啊?怎么整成元胞?

删了一层,元胞的话,在symmetry小finds ymmetry,imposesymmetry,好像就出来了。
8楼2013-05-17 07:45:13
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zuocuiping

木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by 春华秋实2020 at 2013-05-17 07:45:13
删了一层,元胞的话,在symmetry小finds ymmetry,imposesymmetry,好像就出来了。...

请问变成长方形的时候
晶格常数时怎么计算出来的呢?
谢谢
9楼2014-04-18 14:18:04
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黑暗游侠

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主,你用的是什么赝势?石墨烯用传统的能带理论就可以算,没必要用DFT吧,感觉用赝势反而结果可能会有问题
10楼2014-04-18 17:15:18
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