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求助质粒 pGJ103 质粒图谱
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【答案】应助回帖
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shaoml(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香，感谢你的慷慨解囊，期待你的精彩。 2013-05-13 10:07:14
shaoml: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-05-16 08:37:51
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shaoml: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-05-16 08:37:51
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与lacZ方向相同的是pGJ103,方向相反的是pGJ104.贴个我根据资料和序列做的图谱。其中几个CDS的信息是 CDS_11 Start: 840 End: 1235 (Complementary) Original Location Description: complement(15925..16320) Qualifiers: /locus_tag="SAP013A_019" /EC_number="1.20.4.1" /codon_start=1 /transl_table=11 /product="Arsenate reductase" /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937607.1">YP_006937607.1</a> /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506895">GI:410506895</a> /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874755">GeneID:13874755</a> CDS_12 Start: 1253 End: 2542 (Complementary) Original Location Description: complement(16338..17627) Qualifiers: /locus_tag="SAP013A_020" /codon_start=1 /transl_table=11 /product="Arsenic efflux pump protein" /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937608.1">YP_006937608.1</a> /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506896">GI:410506896</a> /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874756">GeneID:13874756</a> CDS_13 Start: 2542 End: 2856 (Complementary) Original Location Description: complement(17627..17941) Qualifiers: /locus_tag="SAP013A_021" /codon_start=1 /transl_table=11 /product="Arsenical resistance operon repressor" /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937609.1">YP_006937609.1</a> /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506897">GI:410506897</a> /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874757">GeneID:13874757</a> |
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2013-05-13 09:18:04, 37.53 K
3楼2013-05-13 09:20:12
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
shaoml(myprayer代发): 金币+1, 感谢你的慷慨解囊，期待你的精彩。 2013-05-13 10:06:52
shaoml: 金币+20, ★有帮助 2013-05-16 08:37:38
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shaoml(myprayer代发): 金币+1, 感谢你的慷慨解囊，期待你的精彩。 2013-05-13 10:06:52
shaoml: 金币+20, ★有帮助 2013-05-16 08:37:38
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ ... acter00077-0276.pdf 文章列了2.7kb序列,这个2.7kb序列插入pUC19的SalI就得到pGJ103. 该2.7kb序列是指质粒pI258的15514-18213的两个SalI之间的序列找到,质粒pI258序列见：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_013319.1 ，单酶切连入pUC19的，按哪个方向插入序列，这个你自己再找点文献看看就好了，确定了用软件vector nti之类可以自己做图谱，不确定方向就先做2个方向的来分析，再自己酶切一下来确定。 |
2楼2013-05-13 09:08:18
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