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shaoml

金虫 (著名写手)

[求助] 求助质粒 pGJ103 质粒图谱

如题,请各位朋友帮助一下,我需要质粒pGJ103的质粒图谱,重金相谢,谢谢!!!
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木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shaoml(myprayer代发): 金币+1, 感谢你的慷慨解囊,期待你的精彩。 2013-05-13 10:06:52
shaoml: 金币+20, 有帮助 2013-05-16 08:37:38
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ ... acter00077-0276.pdf
文章列了2.7kb序列,这个2.7kb序列插入pUC19的SalI就得到pGJ103.
该2.7kb序列是指质粒pI258的15514-18213的两个SalI之间的序列找到,质粒pI258序列见:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_013319.1 ,单酶切连入pUC19的,按哪个方向插入序列,这个你自己再找点文献看看就好了,确定了用软件vector nti之类可以自己做图谱,不确定方向就先做2个方向的来分析,再自己酶切一下来确定。
为什么
2楼2013-05-13 09:08:18
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木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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shaoml(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,感谢你的慷慨解囊,期待你的精彩。 2013-05-13 10:07:14
shaoml: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-05-16 08:37:51
与lacZ方向相同的是pGJ103,方向相反的是pGJ104.贴个我根据资料和序列做的图谱。其中几个CDS的信息是
    CDS_11
      Start: 840   End: 1235 (Complementary)
      Original Location Description:
         complement(15925..16320)
      Qualifiers:
         /locus_tag="SAP013A_019"
         /EC_number="1.20.4.1"
         /codon_start=1
         /transl_table=11
         /product="Arsenate reductase"
         /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937607.1">YP_006937607.1</a>
         /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506895">GI:410506895</a>
         /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874755">GeneID:13874755</a>
    CDS_12
      Start: 1253  End: 2542 (Complementary)
      Original Location Description:
         complement(16338..17627)
      Qualifiers:
         /locus_tag="SAP013A_020"
         /codon_start=1
         /transl_table=11
         /product="Arsenic efflux pump protein"
         /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937608.1">YP_006937608.1</a>
         /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506896">GI:410506896</a>
         /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874756">GeneID:13874756</a>
    CDS_13
      Start: 2542  End: 2856 (Complementary)
      Original Location Description:
         complement(17627..17941)
      Qualifiers:
         /locus_tag="SAP013A_021"
         /codon_start=1
         /transl_table=11
         /product="Arsenical resistance operon repressor"
         /protein_id=<a href="ncbi:protein/YP_006937609.1">YP_006937609.1</a>
         /db_xref=<a href="ncbi:sequence/410506897">GI:410506897</a>
         /db_xref=<a href="ncbilink:geneid/13874757">GeneID:13874757</a>

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  • 附件 1 : pGJ103.JPG
  • 2013-05-13 09:18:04, 37.53 K
为什么
3楼2013-05-13 09:20:12
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