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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 根据蛋白质二级结构分析结果如何看几个α螺旋、无规则卷曲数目怎么算出来
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小恶718

铁虫 (初入文坛)

[求助] 根据蛋白质二级结构分析结果如何看几个α螺旋、无规则卷曲数目怎么算出来

最近得到一段基因序列，已得到二级结构，想请教一下，根据二级结构如何知道α螺旋、β转角及无规则卷曲的数目是怎么知道的。另外还想问一下， β折叠和延伸链有什么区别？
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1楼 2013-05-09 17:41:46
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

圆二色光谱预测蛋白质结构
http://www.bioinfosky.com/thread-814-1-1.html
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3楼2013-05-12 20:37:04
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

可以用圆二色光谱测定出二级结构的相对比例。有具体的软件。β折叠和延伸链不一样。β折叠仍然有蛋白质的曲折。圆二色光谱拟合二级结构的软件程序有：
CDPro软件包（在Windows下可以运行）：http://lamar.colostate.edu/Bsreeram/CDPro/ListPro.htm
UMDNJ（在Windows下可以运行）：http://www2.umdnj.edu/cdrwjweb/
CONTIN（在LINUX下可以运行）：http://s-provencher.com/pages/contin.shtml
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2楼2013-05-12 20:35:59
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