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EAST_黄土地

银虫 (正式写手)

[求助] 怎么快速准确的找氢键的对称代码和原子的对称代码,感谢

怎么快速准确的找氢键的对称代码和原子的对称代码,感谢
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jcajcazhzh

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在ins里加htab命令
2楼2013-05-06 18:00:20
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EAST_黄土地

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jcajcazhzh at 2013-05-06 18:00:20
在ins里加htab命令

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and  <DHA > 110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   <DHA    d(D..A)   A

O4-H4C         0.850    2.056   165.90    2.888    O2 [ x+1, y, z-1 ]

O4-H4D         0.850    2.001   168.33    2.838    N7 [ x, y, z-1 ]

N2-H2          0.860    2.093   158.98    2.912    O7 [ x, y+1, z ]
N2-H2          0.860    2.270   152.25    3.058    O6 [ x, y+1, z ]

N3-H3A         0.860    2.264   167.08    3.108    O5 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]
N3-H3A         0.860    2.315   149.27    3.086    O7 [ x, y+1, z ]

N5-H5          0.860    2.021   170.09    2.872    O7 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]

N6-H6          0.860    2.155   151.80    2.941    O6 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]
N6-H6          0.860    2.584   140.91    3.297    O7 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]

N8-H8          0.860    2.076   166.89    2.920    O6 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]
N8-H8          0.860    2.172   145.62    2.923    O5 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]

N9-H9          0.860    2.160   150.23    2.938    O5 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]
N9-H9          0.860    2.612   141.62    3.329    O6 [ -x+1, -y+1, -z+1 ]

是这个吗   但具体怎么看  谢谢了
3楼2013-05-06 19:07:29
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jcajcazhzh

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by EAST_黄土地 at 2013-05-06 19:07:29
Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and  <DHA > 110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   <DHA    d(D..A)   A

O4-H4C         0.850    2.056   165.90    2.888    O ...

最后一列就是对称代码啊。例如第一行O4-H4C...O2 [ x+1, y, z-1 ]
4楼2013-05-07 08:32:57
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先看你要怎么描述氢键,不是所有的氢键写文章都用,具体代码就是楼上所说的
5楼2013-05-07 11:04:39
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