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xinmutian铁虫 (小有名气)
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[求助]
如何用生物信息学的方法了解新的基因功能
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1、植物全基因组尚未测序 2、我们做的是转录组测序，现在进行到结果已经出来。那么后来对这些差异基因如何进行生物信息学分析 3、研究基因功能一定要把基因转到植株里，然后看表型么？ |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
xinmutian: 金币+5, ★有帮助, 帖子很久了 2013-05-15 17:43:37
xinmutian: 金币+5, ★有帮助, 帖子很久了 2013-05-15 17:43:37
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一般来讲, 大概有这么几件事可以做. 1 显著变化基因功能分析.即变化非常明显的基因,无论上调下调,都仔细的区作功能注释,并分析这些东西和你的实验设计的关系. 1 功能分类,根据你的试验目的,对转录组数据中有差异的基因进行功能注释和分类,来看对照和试验组主要存在哪些大的类别上的差异. 2 pathway富集, 对比较清楚上下游的基因,可以分析哪个通路在你的处理试验中变化较显著. 所有这些,看书估计都会比较慢,我觉得还是看看转录组分析的文章比较快,就照着人家的思路来就是了. |
7楼2013-05-15 12:27:46
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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你的问题太大了，我没有办法回答，给你本书自己参考吧。 MMB408-Gene Function Analysis,免费下载。 |
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2013-05-06 18:00:07, 5.95 M
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xinmutian2楼2013-05-06 17:53:54
smile-1215
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5楼2013-05-15 08:11:43
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6楼2013-05-15 08:15:34
