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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 如何用生物信息学的方法了解新的基因功能
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xinmutian

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何用生物信息学的方法了解新的基因功能

1、植物全基因组尚未测序
2、我们做的是转录组测序，现在进行到结果已经出来。那么后来对这些差异基因如何进行生物信息学分析
3、研究基因功能一定要把基因转到植株里，然后看表型么？
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漫漫科研路，勤勤吾辈人
1楼 2013-05-06 15:43:08
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grape_vine

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xinmutian: 金币+5, ★有帮助, 帖子很久了 2013-05-15 17:43:37
一般来讲, 大概有这么几件事可以做.
1 显著变化基因功能分析.即变化非常明显的基因,无论上调下调,都仔细的区作功能注释,并分析这些东西和你的实验设计的关系.
1 功能分类,根据你的试验目的,对转录组数据中有差异的基因进行功能注释和分类,来看对照和试验组主要存在哪些大的类别上的差异.
2 pathway富集, 对比较清楚上下游的基因,可以分析哪个通路在你的处理试验中变化较显著.

所有这些,看书估计都会比较慢,我觉得还是看看转录组分析的文章比较快,就照着人家的思路来就是了.
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7楼2013-05-15 12:27:46
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查看全部 7 个回答

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的问题太大了，我没有办法回答，给你本书自己参考吧。

MMB408-Gene Function Analysis,免费下载。
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  • 附件 1 : 408-GeneFunctionAnalysis.pdf
    • 2013-05-06 18:00:07, 5.95 M

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xinmutian
2楼2013-05-06 17:53:54
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smile-1215

铜虫 (初入文坛)
你去图书馆借本关于生物信息学方面的书籍，可以找到一些信息哦！
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与阳光风雨同路，快乐常驻！！
5楼2013-05-15 08:11:43
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xinmutian

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by smile-1215 at 2013-05-15 08:11:43
你去图书馆借本关于生物信息学方面的书籍，可以找到一些信息哦！

6楼2013-05-15 08:15:34
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