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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 有谁知道在碳纳米管表面加-OH基团的话，in文件里怎么设置C-OH间的相互作用关系啊？
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)

[求助] 有谁知道在碳纳米管表面加-OH基团的话，in文件里怎么设置C-OH间的相互作用关系啊？

有谁知道在碳纳米管表面加-OH基团的话，in文件里怎么设置C-OH间的相互作用关系啊？
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1楼 2013-05-05 16:47:23
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你先要确定你需要用什么力场吧？然后根据力场来定
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2楼2013-05-05 18:44:51
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-05-05 18:44:51
你先要确定你需要用什么力场吧？然后根据力场来定

恩，我就是想问问它们之间应该用什么势函数表示啊？
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3楼2013-05-06 08:10:06
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apzc2529

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 赞！ 2013-05-06 14:20:14
用 reax，LAMMPS里有CHO的reax
最近有文献给出了CHO的airebo力场，不过没找到力场文件。
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4楼2013-05-06 13:10:21
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by apzc2529 at 2013-05-06 13:10:21
用 reax，LAMMPS里有CHO的reax
最近有文献给出了CHO的airebo力场，不过没找到力场文件。

哦，谢谢啊，你有没有相关文献啊，关于力场参数是多少之类的？
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5楼2013-05-06 14:35:08
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apzc2529

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-05-06 14:59:00
引用回帖:
5楼: Originally posted by 剑雪封侯 at 2013-05-06 14:35:08
哦，谢谢啊，你有没有相关文献啊，关于力场参数是多少之类的？...

lmp自带的reax的力场文件里有相关的参考文献啊，去potentials目录看。

Reactive MD-force field c/h/o combustion force field: Chenoweth, K.; van Duin, A.C.T.; Goddard, W.A. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 1040-1053.
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6楼2013-05-06 14:48:38
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by apzc2529 at 2013-05-06 14:48:38
lmp自带的reax的力场文件里有相关的参考文献啊，去potentials目录看。

Reactive MD-force field c/h/o combustion force field: Chenoweth, K.; van Duin, A.C.T.; Goddard, W.A. J. Phys. Chem. A 2008, 112,  ...

谢谢。
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7楼2013-05-06 14:55:53
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by apzc2529 at 2013-05-06 14:48:38
lmp自带的reax的力场文件里有相关的参考文献啊，去potentials目录看。

Reactive MD-force field c/h/o combustion force field: Chenoweth, K.; van Duin, A.C.T.; Goddard, W.A. J. Phys. Chem. A 2008, 112,  ...

你好，我问下，能用reax里的CHO立场函数来描述碳纳米管原子间共价键的相互作用么？因为lammps里是这么说的“ Currently the reax pair style cannot be used as part of the hybrid pair style”，如果C和-OH之间是用这个力场文件的话，C-C之间可否也用这个？
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8楼2013-05-08 09:43:39
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apzc2529

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-05-09 09:41:10
引用回帖:
8楼: Originally posted by 剑雪封侯 at 2013-05-08 09:43:39
你好，我问下，能用reax里的CHO立场函数来描述碳纳米管原子间共价键的相互作用么？因为lammps里是这么说的“ Currently the reax pair style cannot be used as part of the hybrid pair style”，如果C和-OH之间是 ...

请看手册

As an example, say your LAMMPS simulation has 4 atom types and the elements are ordered as C, H, O, N in the ffield file. If you want the LAMMPS atom type 1 and 2 to be C, type 3 to be N, and type 4 to be H, you would use the following pair_coeff command:

pair_coeff * * ffield.reax 1 1 4 2
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9楼2013-05-08 11:19:58
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by apzc2529 at 2013-05-08 11:19:58
请看手册

As an example, say your LAMMPS simulation has 4 atom types and the elements are ordered as C, H, O, N in the ffield file. If you want the LAMMPS atom type 1 and 2 to be C, type 3 to be  ...

我的系统中又有reax作用，又有L_J的作用，而reax不能和hybrid共存，那应该怎么办呢？
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10楼2013-05-09 09:09:22
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