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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 软件使用与操作 » 【求助】运算fortran的问题,怀疑是不是MPI communication的时候出现问题
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luocycn

新虫 (初入文坛)

[求助] 【求助】运算fortran的问题,怀疑是不是MPI communication的时候出现问题

1. The program code is parallelizedand executed on a high performance computer cluster using 4 processors(by Intel Fortran compiler in Linux systems with OpenMPI)
接下来简单介绍一下程序：
1）        main.f90 是主程序，主要是调用其他程序
2）        主要的计算程序在thermodynamics.f90, tool.f90 and solver.f90
3）        Mpi.f90是communication between processes
4）        Ghostnode.f90是边界条件
5）        Input.f90主要是从input file里读取数据，output.f90就是输出计算结果，inti.f90主要是allocate数组
6）        Global.f90是定义的全局变量
现在我怀疑是不是MPI communication的时候出现问题，因为NaN的值出现在第一个processor的边界上，而且这个程序在自己的电脑（windows）下串行运行是OK的但是当我在超级计算机上必行运算时，程序就不行，然后我用DDT debug，发现在这里出现问题，如下图，然后我进一步check，发现变量xp有四个值是NaN, xp被计算用subroutineconvert_composition(ix,iy)。

2，By the way, 如果要运行这个程序的话需要:
Intel fotransompiler, intelmkl and open MPI.

3.source code 在src  file里， input file 里是需要读入的数据，结果会写在results file里。Makefile是用来compile code的。run.sh是PBS file.

程序在这里：http://pan.baidu.com/share/link? ... p;amp;uk=3305225013

十分感谢！

image001.jpg

[ Last edited by luocycn on 2013-5-4 at 14:52 ]
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1楼 2013-05-04 14:38:09
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abcd702848

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

哥们，我想问问那你是否想过在window7下面运行呢。用mpich2，呵呵，自己的浅见啊
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我想要的，我一定争取；我想要的，但是不符合客观实际的，我会看着
9楼2013-05-28 21:02:01
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kevin123581

金虫 (正式写手)
不好意思啊，我没学MPI ，只会一点openmp，这个估计帮不了你，不好意思
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2楼2013-05-05 11:39:17
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luocycn

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kevin123581 at 2013-05-05 11:39:17
不好意思啊，我没学MPI ，只会一点openmp，这个估计帮不了你，不好意思

我也是初学，这个用的就是OpenMPI ？
by Intel Fortran compiler in Linux systems with OpenMPI
还是谢谢啊
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3楼2013-05-05 16:20:12
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luocycn

新虫 (初入文坛)
继续求助。。。
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4楼2013-05-05 16:20:45
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