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yinzhangqian

铜虫 (小有名气)

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[求助] NCBI中SRA数据库相关求助

如何转化SRA中下载的RNA-Seq的文件到FASTA格式，如何知道RNA-Seq是否包含adaptor？
求高手详细指导

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求索

1楼 2013-05-03 17:14:38

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=3730 提到了

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2楼2013-05-04 07:47:48

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yinzhangqian

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wizardfan: 一般鼓励给思路，而不是具体的步骤 2013-05-06 08:37:24

从ncbi上有看到一些，头大。可能是版本等不一样，操作起来有困难。求具体指导

求索

3楼2013-05-04 08:43:24

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lying_dragon

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【答案】应助回帖

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wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2013-05-06 08:36:24

sra toolkit里面的一个程序dump2fastq来转换sra文件。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

4楼2013-05-05 23:52:34

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