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威莱士

金虫 (小有名气)

[求助] 如何确定公司合成的ssDNA序列的正确性

如题，请教怎么确定公司合成的ssDNA序列的正确性，以及放置时间长之后，怎么确定DNA是不是大部分都被酶解了。我让公司合成了一段30个碱基左右，末端带-SH基的ssDNA，现在实验中感觉DNA坏了，不知道怎么确定，有哪位知道的么，非常感谢！
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1楼 2013-05-03 14:27:56
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
威莱士: 金币+15, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2013-05-03 15:06:35
一般都没问题的，而且各公司不是都提供HPLC或是电泳的质检报告么？DNA干粉或溶解之后零下二十度也能长期保存，DNA是比较皮实的，不像RNA一样容易被酶解。
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2楼2013-05-03 14:59:08
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威莱士

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shixiaba at 2013-05-03 14:59:08
一般都没问题的，而且各公司不是都提供HPLC或是电泳的质检报告么？DNA干粉或溶解之后零下二十度也能长期保存，DNA是比较皮实的，不像RNA一样容易被酶解。

上次合成的那个公司还真没给出HPLC或者电泳报告，另外合成的DNA不会给出质谱的信息吗？怎么确认序列是不是对的呢？
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3楼2013-05-03 15:06:23
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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威莱士: 金币+35, ★★★★★最佳答案 2013-05-28 22:53:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by 威莱士 at 2013-05-03 15:06:23
上次合成的那个公司还真没给出HPLC或者电泳报告，另外合成的DNA不会给出质谱的信息吗？怎么确认序列是不是对的呢？...

质谱信息也有的，我忘了说了～我们一般就是在生工和宝生物买，每次都有质检报告，真没遇到过楼主所说的情况。以前我们也怀疑过序列是不是合成错误，通常会先检查自己的设计和订单，然后检查公司给出的报告。检测序列是否正确最直接的方法就是测序，当然是不是值得就要楼主自己衡量了。还可以用实验进行验证：楼主的链是巯基修饰的，想必是要做偶联，之后再进行反应。可以先把偶联的步骤去掉，然后想办法验证反应的进行 。
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4楼2013-05-03 16:43:47
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