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迷茫的小飞侠

金虫 (正式写手)

[求助] 基于同一结构不同程序转化后的到的坐标不一样?求解...

在使用dalton程序时,使用了Qdalton小程序将gaussian得到的输出格式进行了转化,格式转化以后,发现Qdalton得到的坐标与gaussian对应的坐标不一样,这样对计算的影响大吗?若是有影响,应该使用gaussian View转化得到的坐标还是用QDalton得到的坐标?
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坚强的理由造就非凡的人生!
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zhouwohua

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
迷茫的小飞侠: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-04-30 20:28:20
你的分子有对称性吗?有对称的时候限制下对称点群,gaussian计算有对称性限制分子的时候,坐标都是可以直接用操作矩阵进行变换复原的。
学无止境;天天学习;努力向上。
4楼2013-04-30 09:51:10
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查看全部 11 个回答

yanrding

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-29 20:40:24
迷茫的小飞侠: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-04-30 20:24:32
有可能只是坐标旋转了一下,不影响分子内原子间的键长键角数据就可以。
华北电力大学(北京)数理学院,计算化学,凝聚态物理。欢迎合作!招硕士/博士研究生,招老师。
2楼2013-04-29 10:57:35
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个是原则问题,每个软件都不会开玩笑的,都一样。
3楼2013-04-29 20:13:56
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迷茫的小飞侠

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhouwohua at 2013-04-30 09:51:10
你的分子有对称性吗?有对称的时候限制下对称点群,gaussian计算有对称性限制分子的时候,坐标都是可以直接用操作矩阵进行变换复原的。

分子没有对称性,在计算的时候基本考虑非限制线对称;如是这样,用不同的程序时,即使坐标发生变化,对应的结构参数是不是实质上是没有变化的呢?谢谢
坚强的理由造就非凡的人生!
5楼2013-04-30 20:24:13
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