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heibeidedong

木虫 (正式写手)

[求助] 关于金刚石纳米压痕的in文件

最近写了一个金刚石纳米压痕文件,压头在基体上方2A处,现在设定压头沿着Z轴负方向移动10A,速度为0.01A/PS,时间步长设为0.001PS,按照这样算的话,10/0.01=1000PS,1000/0.001=1000000步,按照这样的计算,需要运行1000000步压头才能到达设定的深度,但事实上运行1800步压头就压入基体了,但是1800*0.001*0.01=0.018A<2A,这样的话压头还没进入基体,所以不知道什么原因,求解,谢谢。以下是in文件。
#3d indenter simulation
units         metal
dimension       3
boundary      p p s

atom_style    atomic
neighbor      2.0 bin
neigh_modify  delay 5.0
lattice       diamond 3.567

read_data     data.0
mass          1 12.0

#Potential Setting

newton        on
pair_style    tersoff
pair_coeff    * * C.tersoff C

#define groups
region 1 block  O 142.68 O 142.68 0 6.62 units box
region 2 block  O 142.68 O 142.68 6.62 20 units box
region 3 block  O 142.68 O 142.68 22 42.68 units box
region 4 block  O 142.68 O 142.68 O 42.68 units box
group 11 region 1
group 22 region 2
group 33 region 3
group 44 region 4
set group 44 type 1
#define velcity
fix 1 44 nve
fix 2 33 rigid/nve single
fix 3 11 setforce 0.0 0.0 0.0
velocity 33 set 0.0 0.0 -0.01 units box
fix dong 33 setforce 0.0 0.0 -0.01

timestep     0.001
thermo              100
thermo_style custom step pe ke

dump              1  all atom 100 dump.atom
dump_modify  1  scale no

run 1000000

#run without indenter
velocity 33 set 0.0 0.0 0.01 units box
unfix dong
run 1000000
Sample Text
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heibeidedong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 张牧童 at 2013-04-26 08:53:52
你好,可不可以把你的data.0文件和C.tersoff C势参数发给我看看,我是初学者,是做涂层方面的~谢谢!

这些东西都可以在网上找到。
努力提高和完善自己
3楼2013-04-29 17:38:54
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张牧童

新虫 (正式写手)

你好,可不可以把你的data.0文件和C.tersoff C势参数发给我看看,我是初学者,是做涂层方面的~谢谢!
2楼2013-04-26 08:53:52
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
heibeidedong: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-03 14:27:41
region 3 block  O 142.68 O 142.68 22 42.68 units box
region 4 block  O 142.68 O 142.68 O 42.68 units box
这2句:区域4包含区域3

fix 1 44 nve
fix 2 33 rigid/nve single
这2句, 对3都有作用, 所以压头实际设定速度为0.02A/PS

fix dong 33 setforce 0.0 0.0 -0.01
为什么要加这个力? 这样压头就一直在加速, 当然失控了。

你看看dump输出的位置,速度,力, 肯定有问题。
4楼2013-05-02 20:36:01
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heibeidedong

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-05-02 20:36:01
region 3 block  O 142.68 O 142.68 22 42.68 units box
region 4 block  O 142.68 O 142.68 O 42.68 units box
这2句:区域4包含区域3

fix 1 44 nve
fix 2 33 rigid/nve single
这2句, 对3都有作用, 所以 ...

我就是想让压头向下移动一定的距离,即压入超胞一定距离,压头向下过程压入超胞,我想用压头整体给超胞施加一个恒定的力,到一定深度,再撤去这个力,改变压头速度方向,使压头向上移动,撤去压头后,压头应该会在超胞上留下一定形状的压痕。麻烦问一下怎样用压头给超胞施加一个力,看了fix中都是每个原子上的力的大小,求解释,谢谢。
努力提高和完善自己
5楼2013-05-03 14:36:37
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